More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1984 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1984  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 365 aa  734    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0196927  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0347  peptide chain release factor 1  86.54 
 
 		 365 aa  648    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23321  peptide chain release factor 1  82.04 
 
 		 367 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16491  peptide chain release factor 1  77.53 
 
 		 365 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0653816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1100  peptide chain release factor 1  74.79 
 
 		 365 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.986414  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19751  peptide chain release factor 1  74.52 
 
 		 365 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17211  peptide chain release factor 1  71.75 
 
 		 364 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17371  peptide chain release factor 1  71.15 
 
 		 364 aa  557  1e-158  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.415096  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1622  peptide chain release factor 1  70.88 
 
 		 364 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17111  peptide chain release factor 1  70.08 
 
 		 364 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241326  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  60.77 
 
 		 368 aa  464  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  59.44 
 
 		 366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2982  peptide chain release factor 1  59.72 
 
 		 369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3733  peptide chain release factor 1  59.44 
 
 		 370 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.971228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  57.3 
 
 		 364 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2589  peptide chain release factor 1  58.5 
 
 		 364 aa  435  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0204  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 370 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0208  peptide chain release factor 1  56.67 
 
 		 370 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17573  predicted protein  54.87 
 
 		 343 aa  396  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36081  predicted protein  52.79 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  44.54 
 
 		 357 aa  339  5e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  50.59 
 
 		 358 aa  338  7e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  44.41 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  45.35 
 
 		 355 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  45.79 
 
 		 357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  44.13 
 
 		 359 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  46.78 
 
 		 383 aa  335  7e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  44.29 
 
 		 362 aa  335  7e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  45.6 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  44.44 
 
 		 358 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  44.16 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  43.79 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  44.16 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  44.16 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  44.16 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  44.16 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  43.79 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  44.16 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  45.88 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  44.07 
 
 		 355 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  44.07 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  46.05 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  44.57 
 
 		 357 aa  326  3e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  46.76 
 
 		 357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  45.2 
 
 		 357 aa  325  6e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  46.09 
 
 		 356 aa  325  6e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  47.32 
 
 		 357 aa  325  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  46.13 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  47.61 
 
 		 357 aa  323  4e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  47.65 
 
 		 372 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  46.18 
 
 		 357 aa  322  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  44.48 
 
 		 357 aa  322  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  45.35 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  44.17 
 
 		 360 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  45.28 
 
 		 361 aa  319  6e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  45.34 
 
 		 360 aa  318  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  45.28 
 
 		 361 aa  319  6e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 360 aa  319  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  43.6 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  44.64 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  42.98 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  42.66 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  44.6 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  45.3 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  47.49 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  46.11 
 
 		 360 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  44.93 
 
 		 362 aa  317  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  45.3 
 
 		 364 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  46.54 
 
 		 360 aa  316  4e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  46.63 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  41.46 
 
 		 357 aa  315  6e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  46.67 
 
 		 360 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  42.86 
 
 		 355 aa  315  8e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  44.19 
 
 		 356 aa  315  8e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  46.78 
 
 		 355 aa  315  9e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  42.18 
 
 		 360 aa  315  9e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  42.18 
 
 		 360 aa  315  9e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  42.74 
 
 		 358 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  44.64 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08900  peptide chain release factor 1  45.33 
 
 		 357 aa  315  9.999999999999999e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000087001  normal  0.899711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  45.98 
 
 		 370 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  44.64 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  45.43 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  44.94 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  46.2 
 
 		 355 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  47.21 
 
 		 361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  45.69 
 
 		 370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  46.3 
 
 		 362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  45.28 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  45.69 
 
 		 370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  47.31 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  42.74 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  43.61 
 
 		 360 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  44.84 
 
 		 359 aa  311  9e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  43.33 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  45.56 
 
 		 360 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  47.38 
 
 		 359 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  44.41 
 
 		 357 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  43.61 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  45.56 
 
 		 360 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>