More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3498 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 383 aa  776    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  55.14 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  56.5 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  55.16 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  52.29 
 
 		 361 aa  371  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  54.72 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  52.57 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  52.63 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  51.94 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  48.74 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  53.04 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  50 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  47.89 
 
 		 358 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  47.61 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 360 aa  363  3e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  47.61 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  47.61 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  47.61 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  47.61 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 		 356 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  52.21 
 
 		 360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  47.59 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  47.59 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  52.75 
 
 		 355 aa  362  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  54.95 
 
 		 355 aa  362  8e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  51.17 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  52.23 
 
 		 361 aa  361  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  52.87 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  48.16 
 
 		 355 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 364 aa  359  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  47.04 
 
 		 358 aa  358  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 359 aa  358  9e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  50.82 
 
 		 364 aa  357  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  51.03 
 
 		 357 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 356 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  52.34 
 
 		 354 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 363 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  50.3 
 
 		 358 aa  354  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 361 aa  353  2e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 361 aa  353  2e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 		 357 aa  353  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  48.43 
 
 		 357 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  52.98 
 
 		 355 aa  352  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  46.89 
 
 		 367 aa  352  8e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  52.86 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  49.13 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  48.84 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2796  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000135616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  48.84 
 
 		 370 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 356 aa  349  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  50.58 
 
 		 363 aa  349  6e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  53.46 
 
 		 354 aa  347  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  53.06 
 
 		 360 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  47.89 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2671  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 358 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0288332 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 359 aa  346  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  48.72 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 359 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  48.61 
 
 		 359 aa  345  6e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  47.41 
 
 		 359 aa  344  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  48.84 
 
 		 372 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  52.17 
 
 		 359 aa  343  2e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  47.9 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  45.48 
 
 		 368 aa  344  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  53.98 
 
 		 355 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  48.34 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  51.14 
 
 		 361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 359 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  47.03 
 
 		 356 aa  342  4e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 360 aa  343  4e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  50.44 
 
 		 357 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  51.86 
 
 		 359 aa  342  4e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 361 aa  343  4e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  51.84 
 
 		 351 aa  342  5e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 		 359 aa  342  5.999999999999999e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0922  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 363 aa  342  7e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.276919  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 359 aa  342  7e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  45.76 
 
 		 364 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  48.77 
 
 		 360 aa  342  9e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  47.26 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 		 377 aa  341  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>