More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0041 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 358 aa  734    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 383 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  51.59 
 
 		 357 aa  371  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  52.23 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  50.45 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  48.79 
 
 		 362 aa  362  8e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  47.95 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  51.48 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 		 357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  48.97 
 
 		 356 aa  352  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  51.16 
 
 		 360 aa  352  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 		 357 aa  352  8e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 		 360 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  50.44 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  46.29 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 359 aa  349  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  49.56 
 
 		 357 aa  349  4e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  51.15 
 
 		 360 aa  349  5e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  48.13 
 
 		 367 aa  348  7e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 355 aa  347  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 361 aa  347  1e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  47.61 
 
 		 358 aa  345  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  48.87 
 
 		 368 aa  345  7e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  48.99 
 
 		 356 aa  345  7e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  47.61 
 
 		 358 aa  345  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  48.97 
 
 		 357 aa  345  7e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  52.65 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  48.04 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 		 359 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 358 aa  344  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  48.55 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  47.65 
 
 		 353 aa  342  4e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  46.7 
 
 		 372 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  47.73 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  51.23 
 
 		 359 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1280  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  47.83 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  45.4 
 
 		 363 aa  339  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  46.26 
 
 		 362 aa  339  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  46.76 
 
 		 358 aa  338  5.9999999999999996e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  45.75 
 
 		 362 aa  338  5.9999999999999996e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 360 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  49.13 
 
 		 361 aa  338  8e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  48.54 
 
 		 359 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  48.15 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  48.01 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  45.76 
 
 		 370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0580  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  45.48 
 
 		 370 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  48.22 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  45.3 
 
 		 362 aa  335  5e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  45.3 
 
 		 362 aa  335  5e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  49.13 
 
 		 354 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2682  peptide chain release factor 1  48.84 
 
 		 357 aa  335  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0279  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 		 347 aa  335  7e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.156801  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  46.48 
 
 		 355 aa  335  7e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  45.2 
 
 		 370 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2982  peptide chain release factor 1  45.73 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  47.16 
 
 		 357 aa  334  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  46.57 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  53.44 
 
 		 354 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  48.7 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  49.04 
 
 		 360 aa  334  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  48.7 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  48.7 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  47.4 
 
 		 360 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  47.23 
 
 		 364 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  47.38 
 
 		 359 aa  332  4e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  48.85 
 
 		 360 aa  332  5e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  45.32 
 
 		 359 aa  332  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0136  peptide chain release factor 1  47.55 
 
 		 359 aa  332  6e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.056338  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1953  peptide chain release factor 1  45.95 
 
 		 357 aa  332  6e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  47.16 
 
 		 361 aa  332  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  47.26 
 
 		 355 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0096  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 357 aa  332  8e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0851  peptide chain release factor 1  47.78 
 
 		 367 aa  332  9e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1044  peptide chain release factor 1  46.71 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0292  peptide chain release factor 1  48.83 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.694941  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1984  peptide chain release factor 1  50.59 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0196927  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0780  peptide chain release factor 1  47.78 
 
 		 367 aa  331  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  43.1 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  47.63 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  46.59 
 
 		 361 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  45.22 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  45.22 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  45.22 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  45.22 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  45.89 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  45.22 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  47.99 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  44.83 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  48.41 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>