More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0292 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0292  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 359 aa  741    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.694941  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 362 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 362 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  54.94 
 
 		 361 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  54.14 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  55.39 
 
 		 364 aa  371  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  54.28 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  56.05 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  55.06 
 
 		 356 aa  368  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  51.59 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  54.94 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  51.59 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  55.72 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1044  peptide chain release factor 1  55.99 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  56.02 
 
 		 359 aa  364  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 360 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 363 aa  361  9e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0523  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  54.84 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  51.73 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  49.31 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 		 361 aa  359  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 360 aa  359  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  49.31 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  49.31 
 
 		 360 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  52.11 
 
 		 362 aa  359  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  53.2 
 
 		 360 aa  359  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  54.3 
 
 		 355 aa  358  6e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  52.91 
 
 		 355 aa  358  9e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  51.71 
 
 		 362 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  49.03 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  49.03 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  52.17 
 
 		 361 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  49.03 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  49.03 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2114  peptide chain release factor 1  55.23 
 
 		 360 aa  357  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2072  peptide chain release factor 1  54.36 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  50.89 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  52.08 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  50.44 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  50.87 
 
 		 360 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 		 354 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2407  peptide chain release factor 1  54.94 
 
 		 360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 363 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 355 aa  355  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 362 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0851  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 367 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  55.22 
 
 		 360 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5476  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0780  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 367 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 363 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  51.3 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  53.71 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  53.58 
 
 		 357 aa  354  2e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  52.66 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  50.73 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  52.17 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  52.17 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  54.07 
 
 		 355 aa  352  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  53.57 
 
 		 356 aa  352  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  52.02 
 
 		 353 aa  352  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1990  peptide chain release factor 1  54.36 
 
 		 361 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00333479  decreased coverage  0.0018191 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  50.88 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1375  peptide chain release factor 1  54.07 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017097  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0790  peptide chain release factor 1  50.69 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  51.01 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01186  peptide chain release factor 1  54.07 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  54.07 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  51.79 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  54.07 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  54.07 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  54.07 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  54.07 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610156  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  50.89 
 
 		 362 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  54.07 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  54.07 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000344623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  51.91 
 
 		 358 aa  349  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 355 aa  349  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 358 aa  349  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 358 aa  349  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  52.54 
 
 		 355 aa  349  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>