More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0922 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0922  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 363 aa  738    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.276919  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  55.98 
 
 		 361 aa  394  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  53.22 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  52.27 
 
 		 356 aa  368  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 357 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  53.51 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 		 358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  48.71 
 
 		 358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  54.3 
 
 		 359 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  48.16 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  48.42 
 
 		 358 aa  360  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  51.61 
 
 		 357 aa  360  3e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  53.07 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  51.7 
 
 		 355 aa  358  6e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  51.72 
 
 		 361 aa  358  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  53.14 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0790  peptide chain release factor 1  50.59 
 
 		 362 aa  355  6.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 362 aa  355  8.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  47.81 
 
 		 360 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  47.81 
 
 		 360 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  48.43 
 
 		 359 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  52.24 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 355 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  49.58 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  52.24 
 
 		 360 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 362 aa  353  4e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  51.29 
 
 		 360 aa  352  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 362 aa  352  8e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  51.86 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  51.86 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  51.86 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  51.86 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49.43 
 
 		 359 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  53.15 
 
 		 360 aa  349  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  51.15 
 
 		 361 aa  348  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  51.46 
 
 		 355 aa  348  8e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 		 360 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  50.73 
 
 		 358 aa  348  9e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 		 360 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 		 360 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 		 360 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 363 aa  347  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 359 aa  347  1e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  52.15 
 
 		 360 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  50.74 
 
 		 362 aa  347  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  48.56 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  47.44 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  48.85 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  52.38 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  46.88 
 
 		 357 aa  347  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1280  peptide chain release factor 1  50.98 
 
 		 366 aa  346  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  50.7 
 
 		 356 aa  345  5e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 363 aa  345  5e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 359 aa  345  7e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 360 aa  345  8.999999999999999e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 356 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 355 aa  344  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  48.25 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  51.04 
 
 		 359 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  48.16 
 
 		 357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2912  peptide chain release factor 1  47.41 
 
 		 361 aa  342  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107492  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 359 aa  342  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 		 357 aa  342  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  48.54 
 
 		 363 aa  342  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  51.44 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  51.44 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  51.44 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 383 aa  342  5.999999999999999e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 355 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 360 aa  342  9e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 360 aa  342  9e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  48.28 
 
 		 361 aa  341  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1607  peptide chain release factor 1  47.19 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317089  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0136  peptide chain release factor 1  50.14 
 
 		 359 aa  341  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.056338  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  51 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  47.44 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  51.94 
 
 		 359 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  48.67 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  48.67 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  51.03 
 
 		 351 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  51.64 
 
 		 359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>