More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1622 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_17211  peptide chain release factor 1  97.53 
 
 		 364 aa  730    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1622  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 364 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17111  peptide chain release factor 1  90.66 
 
 		 364 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241326  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17371  peptide chain release factor 1  98.63 
 
 		 364 aa  738    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.415096  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1100  peptide chain release factor 1  78.95 
 
 		 365 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.986414  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19751  peptide chain release factor 1  78.67 
 
 		 365 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23321  peptide chain release factor 1  73.68 
 
 		 367 aa  574  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16491  peptide chain release factor 1  75.21 
 
 		 365 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0653816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0347  peptide chain release factor 1  70.64 
 
 		 365 aa  549  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1984  peptide chain release factor 1  70.88 
 
 		 365 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0196927  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  57.98 
 
 		 368 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2982  peptide chain release factor 1  59.05 
 
 		 369 aa  445  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  58.5 
 
 		 366 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3733  peptide chain release factor 1  59 
 
 		 370 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.971228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  55.71 
 
 		 364 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2589  peptide chain release factor 1  57.54 
 
 		 364 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0204  peptide chain release factor 1  58.22 
 
 		 370 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0208  peptide chain release factor 1  57.94 
 
 		 370 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17573  predicted protein  54.84 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36081  predicted protein  53.45 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 		 355 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  47.71 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 367 aa  348  8e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  46.26 
 
 		 357 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  46.84 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  45.89 
 
 		 359 aa  332  5e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  47.85 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  48.4 
 
 		 355 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  44.35 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  47.23 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  46.5 
 
 		 358 aa  329  5.0000000000000004e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  47.08 
 
 		 358 aa  329  5.0000000000000004e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  45.04 
 
 		 355 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  45.61 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  46.52 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  46.56 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  46.56 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 		 355 aa  325  9e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  44.69 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  47.28 
 
 		 357 aa  323  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  44.54 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  44.54 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  46.36 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  44.85 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  48.18 
 
 		 355 aa  323  4e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  47.2 
 
 		 360 aa  323  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  47.47 
 
 		 356 aa  322  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  48.29 
 
 		 360 aa  322  8e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  44.48 
 
 		 355 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  44.48 
 
 		 355 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  44.48 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  44.48 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  44.48 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  43.75 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  46.82 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  44.19 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  44.48 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  44.48 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  43.91 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  43.82 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  46.82 
 
 		 370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  44.48 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  45.28 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  46.82 
 
 		 370 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  45.66 
 
 		 364 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  45.28 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  43.91 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  48 
 
 		 359 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  46.7 
 
 		 357 aa  319  5e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  49.21 
 
 		 359 aa  319  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  47.9 
 
 		 355 aa  318  7e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  46.99 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  47.08 
 
 		 355 aa  318  1e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  45.58 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  46.75 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  44.54 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  46.97 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  44.38 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  47.56 
 
 		 355 aa  316  3e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 360 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  44.88 
 
 		 383 aa  316  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  44.19 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  43.39 
 
 		 357 aa  315  6e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  47.84 
 
 		 361 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  47.47 
 
 		 356 aa  315  8e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  45.07 
 
 		 359 aa  315  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  48.04 
 
 		 360 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  47.26 
 
 		 357 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  46.89 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  47.48 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  43.21 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  46.91 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 		 360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0015  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  47.65 
 
 		 361 aa  311  9e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  46.02 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  44.07 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  44.82 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>