More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23321 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_23321  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 367 aa  742    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0347  peptide chain release factor 1  81.1 
 
 		 365 aa  608  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19751  peptide chain release factor 1  78.3 
 
 		 365 aa  597  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1100  peptide chain release factor 1  78.02 
 
 		 365 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.986414  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1984  peptide chain release factor 1  82.04 
 
 		 365 aa  593  1e-168  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0196927  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16491  peptide chain release factor 1  79.45 
 
 		 365 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0653816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17211  peptide chain release factor 1  74.44 
 
 		 364 aa  577  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17371  peptide chain release factor 1  73.76 
 
 		 364 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.415096  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1622  peptide chain release factor 1  73.68 
 
 		 364 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17111  peptide chain release factor 1  72.73 
 
 		 364 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241326  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  58.9 
 
 		 368 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2982  peptide chain release factor 1  58.61 
 
 		 369 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3733  peptide chain release factor 1  57.97 
 
 		 370 aa  434  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.971228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 366 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  56.39 
 
 		 364 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2589  peptide chain release factor 1  56.55 
 
 		 364 aa  423  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0208  peptide chain release factor 1  56.87 
 
 		 370 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0204  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 370 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192839 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17573  predicted protein  54.09 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36081  predicted protein  50.98 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  47.32 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  46.35 
 
 		 357 aa  338  9e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  45.66 
 
 		 357 aa  337  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  47.22 
 
 		 367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  46.74 
 
 		 355 aa  334  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  46.2 
 
 		 383 aa  330  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  45.92 
 
 		 356 aa  328  7e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  44.63 
 
 		 357 aa  325  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  42.58 
 
 		 359 aa  323  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  46.09 
 
 		 361 aa  323  4e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  46.09 
 
 		 361 aa  323  4e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  46.63 
 
 		 356 aa  322  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  45 
 
 		 356 aa  322  6e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  45.36 
 
 		 370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  43.77 
 
 		 355 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  45.36 
 
 		 370 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  44.9 
 
 		 359 aa  319  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  42.06 
 
 		 360 aa  319  6e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  42.06 
 
 		 360 aa  319  6e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  42.3 
 
 		 359 aa  318  9e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  45.98 
 
 		 372 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  46.33 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  44.72 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  45.08 
 
 		 370 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  47.11 
 
 		 360 aa  316  5e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  44.9 
 
 		 359 aa  316  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  43.33 
 
 		 361 aa  315  6e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  42.18 
 
 		 362 aa  315  6e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  44.48 
 
 		 357 aa  315  7e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  46.33 
 
 		 357 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  42.21 
 
 		 355 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  44.13 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  42.42 
 
 		 362 aa  314  9.999999999999999e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  46.52 
 
 		 358 aa  315  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  41.97 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  45.76 
 
 		 357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  46.52 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  46.75 
 
 		 360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  41.93 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  41.93 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  43.45 
 
 		 357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  41.69 
 
 		 358 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  41.69 
 
 		 358 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  41.69 
 
 		 358 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  41.69 
 
 		 358 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  43.98 
 
 		 360 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  41.69 
 
 		 358 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  43.92 
 
 		 364 aa  312  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  41.69 
 
 		 358 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  44.32 
 
 		 355 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  44.57 
 
 		 363 aa  311  7.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  43.26 
 
 		 359 aa  311  9e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  44.41 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  42.49 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  41.78 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  44.88 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  44.29 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  44.69 
 
 		 360 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  46.78 
 
 		 355 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  44.48 
 
 		 360 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  44.69 
 
 		 360 aa  309  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  43.42 
 
 		 360 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  44.97 
 
 		 361 aa  308  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  45.4 
 
 		 361 aa  308  8e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  42.62 
 
 		 358 aa  307  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  42.34 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  42.62 
 
 		 358 aa  307  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  44.61 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  44.29 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  46.77 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  46.18 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  44.97 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  46.63 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  42.7 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  43.91 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  43.09 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  43.85 
 
 		 360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  46.48 
 
 		 361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  43.85 
 
 		 360 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  43.85 
 
 		 360 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>