More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1784 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 356 aa  733    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  64.15 
 
 		 362 aa  487  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  63.2 
 
 		 357 aa  483  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  61.62 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  62.75 
 
 		 359 aa  464  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  63.03 
 
 		 359 aa  462  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  60.5 
 
 		 357 aa  454  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  56.13 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  55.08 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  54.8 
 
 		 358 aa  408  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 		 355 aa  408  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  54.52 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 		 357 aa  381  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  51.33 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  52.21 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  54.18 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  51.03 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  51.32 
 
 		 372 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  50.73 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  52.84 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  50.44 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  52.51 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl634  peptide chain release factor 1  50.42 
 
 		 363 aa  368  1e-101  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  54.18 
 
 		 359 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  49.15 
 
 		 356 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4995  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  0.116267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  53.1 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  51.41 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  51.13 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  51.91 
 
 		 360 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  50.56 
 
 		 363 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 360 aa  362  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 		 360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  50.44 
 
 		 355 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  50.59 
 
 		 355 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 		 360 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 		 360 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  52.21 
 
 		 360 aa  361  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 360 aa  361  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 360 aa  361  9e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  52.21 
 
 		 360 aa  361  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  51.69 
 
 		 360 aa  361  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  50.86 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  51.92 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  47.56 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 356 aa  360  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 360 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 360 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 360 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 360 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  49.01 
 
 		 359 aa  359  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  51.91 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  51.91 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  51.91 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 		 358 aa  359  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 		 356 aa  359  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  52.51 
 
 		 360 aa  358  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 368 aa  358  8e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0144  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 363 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372762  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  47.58 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  47.04 
 
 		 357 aa  357  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  49.13 
 
 		 355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2982  peptide chain release factor 1  47.89 
 
 		 369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  49.44 
 
 		 360 aa  355  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  48.73 
 
 		 357 aa  355  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  46.5 
 
 		 358 aa  355  5.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  45.89 
 
 		 357 aa  355  8.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  51.47 
 
 		 358 aa  354  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  46.61 
 
 		 367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  47.62 
 
 		 360 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  47.71 
 
 		 356 aa  352  5e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0075  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 		 358 aa  352  5e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1044  peptide chain release factor 1  51.46 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 354 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  47.04 
 
 		 364 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  49.26 
 
 		 355 aa  348  8e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  45.51 
 
 		 361 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>