More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16491 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_16491  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 365 aa  738    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0653816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19751  peptide chain release factor 1  81.37 
 
 		 365 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1100  peptide chain release factor 1  81.1 
 
 		 365 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.986414  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23321  peptide chain release factor 1  79.45 
 
 		 367 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17211  peptide chain release factor 1  75.07 
 
 		 364 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17371  peptide chain release factor 1  74.59 
 
 		 364 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.415096  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1622  peptide chain release factor 1  75.21 
 
 		 364 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0347  peptide chain release factor 1  77.75 
 
 		 365 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17111  peptide chain release factor 1  73.68 
 
 		 364 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241326  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1984  peptide chain release factor 1  77.53 
 
 		 365 aa  566  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0196927  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  58.15 
 
 		 368 aa  442  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2982  peptide chain release factor 1  58.4 
 
 		 369 aa  442  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  56.67 
 
 		 364 aa  434  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  57.85 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3733  peptide chain release factor 1  57.87 
 
 		 370 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.971228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2589  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 		 364 aa  422  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0208  peptide chain release factor 1  56.16 
 
 		 370 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0204  peptide chain release factor 1  56.44 
 
 		 370 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192839 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36081  predicted protein  53.8 
 
 		 358 aa  391  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17573  predicted protein  54.46 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  47.89 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  46.74 
 
 		 355 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  48.41 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  45.51 
 
 		 357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  47.26 
 
 		 383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  45.22 
 
 		 362 aa  326  3e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  45.99 
 
 		 356 aa  324  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  43.75 
 
 		 359 aa  322  9.000000000000001e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  46.2 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  48.99 
 
 		 370 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  45.89 
 
 		 361 aa  319  6e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  45.89 
 
 		 361 aa  319  6e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  48.99 
 
 		 370 aa  318  6e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  48.37 
 
 		 355 aa  318  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  44.93 
 
 		 357 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  46.24 
 
 		 355 aa  318  1e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  43.91 
 
 		 360 aa  317  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  43.91 
 
 		 360 aa  317  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  48.56 
 
 		 370 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  45.98 
 
 		 358 aa  317  3e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  45.28 
 
 		 360 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  45.17 
 
 		 358 aa  315  6e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  43.47 
 
 		 359 aa  315  7e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  45.29 
 
 		 357 aa  315  7e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  45.4 
 
 		 360 aa  315  8e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  46.35 
 
 		 359 aa  315  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  43.3 
 
 		 362 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  43.3 
 
 		 362 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  42.78 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  46.48 
 
 		 357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  45.83 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  46.39 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  45.83 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  45.91 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  46.96 
 
 		 356 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  44.74 
 
 		 360 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  44.6 
 
 		 358 aa  312  6.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  44.6 
 
 		 358 aa  312  6.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  44.06 
 
 		 355 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  42.5 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  45.28 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  43.84 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  43.5 
 
 		 358 aa  311  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  43.92 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  45.07 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  43.77 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  46.11 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  43.77 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  43.77 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  43.77 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  43.77 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  43.77 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  43.77 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  43.77 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  43.77 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  43.77 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  42.5 
 
 		 360 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  42.5 
 
 		 360 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  42.5 
 
 		 360 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  47.11 
 
 		 364 aa  309  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  45.38 
 
 		 357 aa  309  5e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  47.11 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  43.34 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  46.04 
 
 		 357 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  46.63 
 
 		 359 aa  308  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  45.87 
 
 		 361 aa  308  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  45.38 
 
 		 357 aa  308  8e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  42.22 
 
 		 360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  45.28 
 
 		 360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  42.22 
 
 		 360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_993  peptide chain release factor 1  45.24 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.394955  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  42.22 
 
 		 360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  42.22 
 
 		 360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0074  peptide chain release factor 1  47.89 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  43.86 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  42.78 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0015  peptide chain release factor 1  46.13 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  42.78 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>