More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0347 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0347  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 365 aa  732    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1984  peptide chain release factor 1  86.54 
 
 		 365 aa  630  1e-179  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0196927  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23321  peptide chain release factor 1  81.1 
 
 		 367 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16491  peptide chain release factor 1  77.75 
 
 		 365 aa  567  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0653816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19751  peptide chain release factor 1  75.27 
 
 		 365 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1100  peptide chain release factor 1  75.27 
 
 		 365 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.986414  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17211  peptide chain release factor 1  71.11 
 
 		 364 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1622  peptide chain release factor 1  70.64 
 
 		 364 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17111  peptide chain release factor 1  70.17 
 
 		 364 aa  547  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241326  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17371  peptide chain release factor 1  70.25 
 
 		 364 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.415096  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  59.18 
 
 		 368 aa  457  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 366 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3733  peptide chain release factor 1  59.07 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.971228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2982  peptide chain release factor 1  58.06 
 
 		 369 aa  444  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2589  peptide chain release factor 1  58.56 
 
 		 364 aa  434  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  56.11 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0204  peptide chain release factor 1  58.31 
 
 		 370 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0208  peptide chain release factor 1  58.04 
 
 		 370 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17573  predicted protein  55.19 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36081  predicted protein  51.96 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  47.04 
 
 		 355 aa  349  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  47.54 
 
 		 367 aa  345  6e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  47.95 
 
 		 383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  46.89 
 
 		 355 aa  339  5e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  45.79 
 
 		 357 aa  338  8e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  44.82 
 
 		 357 aa  336  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  44.54 
 
 		 359 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  46.47 
 
 		 356 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  43.98 
 
 		 359 aa  335  1e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  45.89 
 
 		 357 aa  331  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  48.29 
 
 		 370 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  48.29 
 
 		 370 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  48.29 
 
 		 370 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  46.65 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  43.22 
 
 		 358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  42.74 
 
 		 362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  43.22 
 
 		 355 aa  325  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  42.94 
 
 		 355 aa  325  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  42.94 
 
 		 355 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 357 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  42.94 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  42.94 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  47.32 
 
 		 355 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  42.94 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  42.94 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  45.56 
 
 		 360 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  46.39 
 
 		 360 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  42.94 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  47.43 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  42.02 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  42.02 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  42.66 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  46.13 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  43.53 
 
 		 362 aa  323  3e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  44.54 
 
 		 357 aa  323  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  45.53 
 
 		 361 aa  323  4e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  45.53 
 
 		 361 aa  323  4e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  43.45 
 
 		 357 aa  323  4e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  43.02 
 
 		 358 aa  323  4e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  43.22 
 
 		 355 aa  322  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  46.22 
 
 		 357 aa  322  7e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  46.39 
 
 		 360 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  42.42 
 
 		 357 aa  322  9.000000000000001e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  47.04 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  42.9 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  43.7 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  46.11 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  45.28 
 
 		 360 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  47.11 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  44.01 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  46.11 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  44.72 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  44.32 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  46.11 
 
 		 360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  46.78 
 
 		 358 aa  319  5e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  43.61 
 
 		 360 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  46.5 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  42.9 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  46.11 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  45.3 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  44.04 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  44.88 
 
 		 355 aa  316  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  46.39 
 
 		 360 aa  315  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  46.74 
 
 		 360 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  44.94 
 
 		 356 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  45.91 
 
 		 360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  47.63 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  43.61 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  43.85 
 
 		 358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  44.77 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  45.29 
 
 		 357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  43.21 
 
 		 360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  43.33 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  45.96 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  43.33 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  43.33 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  43.21 
 
 		 360 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  44.23 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  44.51 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>