More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1100 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1100  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 365 aa  745    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.986414  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19751  peptide chain release factor 1  99.73 
 
 		 365 aa  744    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16491  peptide chain release factor 1  81.1 
 
 		 365 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0653816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1622  peptide chain release factor 1  78.95 
 
 		 364 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17211  peptide chain release factor 1  79.17 
 
 		 364 aa  600  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17371  peptide chain release factor 1  79.01 
 
 		 364 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.415096  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23321  peptide chain release factor 1  78.02 
 
 		 367 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17111  peptide chain release factor 1  76.16 
 
 		 364 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241326  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0347  peptide chain release factor 1  75.27 
 
 		 365 aa  565  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1984  peptide chain release factor 1  74.79 
 
 		 365 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0196927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2982  peptide chain release factor 1  58.13 
 
 		 369 aa  449  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  56.39 
 
 		 364 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  56.87 
 
 		 368 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  56.75 
 
 		 366 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3733  peptide chain release factor 1  57.42 
 
 		 370 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.971228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2589  peptide chain release factor 1  56.55 
 
 		 364 aa  422  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0204  peptide chain release factor 1  57.42 
 
 		 370 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0208  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 370 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17573  predicted protein  56.08 
 
 		 343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36081  predicted protein  51.96 
 
 		 358 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  46.5 
 
 		 357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  47.32 
 
 		 355 aa  342  8e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  46.63 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  45.63 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  48.06 
 
 		 367 aa  332  5e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  48.06 
 
 		 361 aa  331  9e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  48.06 
 
 		 361 aa  331  9e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  46.05 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  46.29 
 
 		 372 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  46.61 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  43.63 
 
 		 355 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  43.82 
 
 		 359 aa  322  6e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  46.99 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  43.42 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  46.2 
 
 		 383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  46.24 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  47.24 
 
 		 359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  45.61 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  43.53 
 
 		 358 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  45.53 
 
 		 358 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  43.53 
 
 		 358 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  43.42 
 
 		 360 aa  319  5e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  43.42 
 
 		 360 aa  319  5e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  45.76 
 
 		 357 aa  319  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  43.06 
 
 		 358 aa  317  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  46.05 
 
 		 357 aa  318  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  45 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  42.78 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  44.82 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  42.98 
 
 		 359 aa  317  3e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  42.78 
 
 		 355 aa  316  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  42.78 
 
 		 355 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  42.78 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  42.78 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  42.78 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  42.78 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  42.78 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  42.78 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0119  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 		 357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  43.92 
 
 		 363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  45.71 
 
 		 370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  45.71 
 
 		 370 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  45.71 
 
 		 370 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  42.06 
 
 		 362 aa  312  5.999999999999999e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  45.04 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  46.7 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0074  peptide chain release factor 1  45 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  43.06 
 
 		 355 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  42.86 
 
 		 357 aa  310  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  46.2 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  49.06 
 
 		 361 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  41.23 
 
 		 357 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  49.06 
 
 		 361 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  44.44 
 
 		 360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  48.44 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  44.44 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  42.94 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  45.51 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  42.58 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2682  peptide chain release factor 1  46.05 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  48.01 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_993  peptide chain release factor 1  44.29 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.394955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0096  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000153667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  45.07 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  45.61 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  44.92 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  45.81 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  44.29 
 
 		 354 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  44.44 
 
 		 360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  40.77 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  42.74 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  45.03 
 
 		 360 aa  305  7e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  41.71 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  43.06 
 
 		 355 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  44.72 
 
 		 360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  46.82 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  46 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  44.77 
 
 		 351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  44.72 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>