More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_17111 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_17111  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 364 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241326  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1622  peptide chain release factor 1  90.66 
 
 		 364 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17211  peptide chain release factor 1  90.38 
 
 		 364 aa  685    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17371  peptide chain release factor 1  90.93 
 
 		 364 aa  689    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.415096  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19751  peptide chain release factor 1  75.89 
 
 		 365 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1100  peptide chain release factor 1  76.16 
 
 		 365 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.986414  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23321  peptide chain release factor 1  72.73 
 
 		 367 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16491  peptide chain release factor 1  73.68 
 
 		 365 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0653816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0347  peptide chain release factor 1  70.17 
 
 		 365 aa  547  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1984  peptide chain release factor 1  70.08 
 
 		 365 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0196927  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  58.5 
 
 		 368 aa  442  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0721  peptide chain release factor 1  58.64 
 
 		 366 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000614625  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2982  peptide chain release factor 1  57.94 
 
 		 369 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3733  peptide chain release factor 1  58.08 
 
 		 370 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.971228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2589  peptide chain release factor 1  57.54 
 
 		 364 aa  425  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1003  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 		 364 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000454931  normal  0.0279462 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0208  peptide chain release factor 1  57.38 
 
 		 370 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0204  peptide chain release factor 1  57.66 
 
 		 370 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192839 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17573  predicted protein  55.49 
 
 		 343 aa  396  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36081  predicted protein  52.25 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  51.83 
 
 		 355 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  47.99 
 
 		 357 aa  349  4e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 367 aa  342  8e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  47.81 
 
 		 372 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  44.83 
 
 		 357 aa  329  6e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  47.81 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  47.49 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  45.86 
 
 		 359 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  47.08 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  43.98 
 
 		 362 aa  323  4e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  45.86 
 
 		 359 aa  322  5e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0010  peptide chain release factor 1  46.42 
 
 		 357 aa  322  5e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  47.85 
 
 		 360 aa  322  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  44.83 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  44.85 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  44.13 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  46.42 
 
 		 357 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  44.19 
 
 		 355 aa  319  5e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  44.66 
 
 		 358 aa  319  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  46.02 
 
 		 359 aa  319  6e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  46.06 
 
 		 370 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  44.66 
 
 		 358 aa  319  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  46.13 
 
 		 357 aa  318  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  48 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  46.06 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  46 
 
 		 361 aa  317  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  46 
 
 		 361 aa  317  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  47.13 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  46.13 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  46.2 
 
 		 383 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1784  peptide chain release factor 1  44.66 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  43.47 
 
 		 356 aa  316  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 356 aa  316  3e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4117  peptide chain release factor 1  45.19 
 
 		 357 aa  316  4e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  44.96 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  44.01 
 
 		 357 aa  316  4e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  43.34 
 
 		 355 aa  315  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  43.34 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1784  peptide chain release factor 1  46.5 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.404701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  46.36 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  43.34 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  43.34 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  43.34 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  43.34 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  43.34 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  43.34 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  45.7 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  43.45 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  43.45 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0610  peptide chain release factor 1  44.97 
 
 		 357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0746132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  46.2 
 
 		 357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  43.34 
 
 		 358 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  42.9 
 
 		 358 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  43.84 
 
 		 364 aa  312  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  45.63 
 
 		 359 aa  312  4.999999999999999e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  42.78 
 
 		 358 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  46.22 
 
 		 355 aa  312  6.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  47.26 
 
 		 361 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  45.22 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  46.42 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  46.15 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  45.69 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  46.3 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  43.39 
 
 		 357 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  47.2 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  45.07 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  46.7 
 
 		 355 aa  310  4e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  46.65 
 
 		 359 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  46.65 
 
 		 377 aa  308  6.999999999999999e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  48.45 
 
 		 360 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1966  peptide chain release factor 1  45.94 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  45.24 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  43.68 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  44.57 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  49.37 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  44.73 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  45.87 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  43.18 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0074  peptide chain release factor 1  47.69 
 
 		 355 aa  306  3e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>