More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0609 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0609  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 370 aa  731    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.135103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2868  peptide chain release factor 1  53.33 
 
 		 364 aa  355  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2429  peptide chain release factor 1  53.04 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0447766  normal  0.0852947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  52.33 
 
 		 361 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2796  peptide chain release factor 1  53.49 
 
 		 365 aa  342  5e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000135616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  51.3 
 
 		 355 aa  342  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  48.85 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  52.41 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  50.29 
 
 		 357 aa  335  9e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 		 356 aa  334  2e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  51.17 
 
 		 355 aa  333  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  46.22 
 
 		 360 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  46.22 
 
 		 360 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  51.73 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  51.06 
 
 		 359 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  47.9 
 
 		 360 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  47.37 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2671  peptide chain release factor 1  52.94 
 
 		 358 aa  326  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0288332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  50.76 
 
 		 359 aa  325  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  45.33 
 
 		 361 aa  326  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  48.55 
 
 		 356 aa  323  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  47.4 
 
 		 356 aa  322  5e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  50.16 
 
 		 360 aa  322  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  47.74 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  47.54 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2757  peptide chain release factor 1  53.37 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 360 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  46.39 
 
 		 357 aa  320  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 356 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  46.91 
 
 		 359 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  47.37 
 
 		 360 aa  319  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  47.88 
 
 		 356 aa  319  5e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 354 aa  318  7e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  47.54 
 
 		 360 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  47.54 
 
 		 360 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 360 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 355 aa  318  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 360 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 360 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  46.94 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  47.4 
 
 		 353 aa  317  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  46.18 
 
 		 356 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  44.38 
 
 		 361 aa  316  4e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5476  peptide chain release factor 1  46.8 
 
 		 360 aa  315  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  48.17 
 
 		 360 aa  315  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  46.96 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  46.94 
 
 		 360 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  47.25 
 
 		 383 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1891  peptide chain release factor 1  46.31 
 
 		 352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.871693  hitchhiker  0.000000000024235 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  45.15 
 
 		 360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  48.56 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14260  peptide chain release factor 1  45.87 
 
 		 352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.210236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  47.09 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  44.29 
 
 		 361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  45.15 
 
 		 360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  46.38 
 
 		 360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  45.38 
 
 		 360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  45.15 
 
 		 360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  45.15 
 
 		 360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  44.29 
 
 		 361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  44.66 
 
 		 359 aa  312  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  46.18 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2203  peptide chain release factor 1  44.92 
 
 		 368 aa  312  5.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.930883 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  45.94 
 
 		 358 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  45.93 
 
 		 357 aa  312  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  44.32 
 
 		 363 aa  311  7.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  46.61 
 
 		 360 aa  311  9e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  44.88 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  44.88 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  44.88 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  46.09 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  44.88 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  44.38 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  46.29 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0851  peptide chain release factor 1  46.47 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  46.94 
 
 		 361 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  46.15 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0780  peptide chain release factor 1  46.47 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  45.2 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  46.55 
 
 		 360 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  47.06 
 
 		 360 aa  309  5e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3664  peptide chain release factor 1  48.89 
 
 		 360 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  44.07 
 
 		 358 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  44.63 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  47.09 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  45.96 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  46.33 
 
 		 359 aa  306  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  47.97 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  48.6 
 
 		 360 aa  305  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0347  peptide chain release factor 1  48.03 
 
 		 365 aa  305  7e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  45.56 
 
 		 360 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  44.35 
 
 		 358 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  47.91 
 
 		 355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  44.38 
 
 		 362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  45.74 
 
 		 370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  45.74 
 
 		 370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>