More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1636 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1636  (Uracil-5)-methyltransferase  100 
 
 
412 aa  818    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103701  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2161  (Uracil-5)-methyltransferase  66.67 
 
 
398 aa  527  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.243415 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1777  (Uracil-5)-methyltransferase  40.68 
 
 
410 aa  258  9e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0172693  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.89 
 
 
455 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  30.18 
 
 
457 aa  151  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0678  RNA methyltransferase, TrmA family  25.3 
 
 
415 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  29.01 
 
 
457 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  26.92 
 
 
435 aa  143  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  26.62 
 
 
453 aa  143  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  25.73 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2200  RNA methyltransferase, TrmA family  30.02 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  26.05 
 
 
419 aa  140  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  29.27 
 
 
456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  28.94 
 
 
446 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  29.29 
 
 
455 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  26.79 
 
 
419 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  25.34 
 
 
458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  26.42 
 
 
462 aa  137  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0652  RNA methyltransferase, TrmA family  29.71 
 
 
441 aa  137  5e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000483498  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  26.41 
 
 
454 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  26.8 
 
 
459 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  28.89 
 
 
468 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  29.98 
 
 
405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  24.33 
 
 
458 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  27.73 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  29.94 
 
 
479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  24.66 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1248  RNA methyltransferase, TrmA family  29.98 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  24.78 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  25.17 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  29.98 
 
 
407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  30.05 
 
 
434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  24.56 
 
 
453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  26.11 
 
 
450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06020  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.82 
 
 
444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.14779  hitchhiker  0.000000000313227 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  25.69 
 
 
439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  24.72 
 
 
460 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  23.09 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  27.52 
 
 
489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1715  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  28.44 
 
 
449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167025  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  23.39 
 
 
488 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  24.55 
 
 
454 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  26.4 
 
 
451 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  24.33 
 
 
458 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  24.33 
 
 
458 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  24.33 
 
 
458 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  26.95 
 
 
457 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  27.44 
 
 
457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  31.29 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.58 
 
 
441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0844867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  28.08 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  27.63 
 
 
428 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  23.04 
 
 
452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  24.79 
 
 
476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  24.77 
 
 
439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  29.39 
 
 
457 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  27.07 
 
 
473 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  24.4 
 
 
448 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  27.31 
 
 
455 aa  126  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  29.29 
 
 
439 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  24.11 
 
 
458 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  24.11 
 
 
458 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  29.76 
 
 
441 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  26.36 
 
 
446 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  25.56 
 
 
460 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  23.93 
 
 
482 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  25.8 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  25.11 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  24.89 
 
 
455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  29.04 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  28.35 
 
 
493 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  21.41 
 
 
473 aa  119  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.89 
 
 
465 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14530  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  28.98 
 
 
440 aa  119  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  28.98 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  27.01 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  25.33 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  25.33 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  26.54 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  26.89 
 
 
488 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  28.98 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4525  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  27.53 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1944  (Uracil-5)-methyltransferase  28.34 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  28.04 
 
 
419 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  28.1 
 
 
470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  24.84 
 
 
481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  25.33 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  28.28 
 
 
437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  25.28 
 
 
459 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  25.28 
 
 
459 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  25.28 
 
 
459 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  25.28 
 
 
459 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2239  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.19 
 
 
449 aa  117  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0615  RNA methyltransferase  28.33 
 
 
423 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13964  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  23.42 
 
 
446 aa  116  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  24.14 
 
 
477 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  28.19 
 
 
469 aa  116  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  23.79 
 
 
476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  24.84 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  26.36 
 
 
466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>