More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1777 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1777  (Uracil-5)-methyltransferase  100 
 
 		 410 aa  801    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0172693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2161  (Uracil-5)-methyltransferase  43.5 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.243415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1636  (Uracil-5)-methyltransferase  40.68 
 
 		 412 aa  258  9e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  30.94 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  32.13 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  29.86 
 
 		 459 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  29.86 
 
 		 459 aa  152  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.86 
 
 		 459 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.86 
 
 		 459 aa  152  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  29.77 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  29.77 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  30.2 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  29.86 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.86 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  31.32 
 
 		 457 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  30.14 
 
 		 459 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2200  RNA methyltransferase, TrmA family  31.91 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.66 
 
 		 450 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  26.05 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  29.95 
 
 		 459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.86 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.84 
 
 		 455 aa  146  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  25.28 
 
 		 451 aa  146  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  29.27 
 
 		 457 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  31.42 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  29.51 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf754  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  24.26 
 
 		 449 aa  143  5e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  30.94 
 
 		 457 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  28.25 
 
 		 462 aa  143  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1248  RNA methyltransferase, TrmA family  32.82 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  26.64 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  28.54 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  24.01 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  28.99 
 
 		 572 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.66 
 
 		 455 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  28.31 
 
 		 458 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  27.97 
 
 		 460 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  31 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  26.68 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  30.38 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  28.83 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  27.21 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  28.25 
 
 		 458 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  28.25 
 
 		 454 aa  136  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  28.54 
 
 		 489 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  28.25 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  28.48 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  28.19 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  28.25 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  28.48 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  28.48 
 
 		 458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  28.48 
 
 		 458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  29.82 
 
 		 482 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  24.31 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  27.72 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  29.93 
 
 		 405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  30.7 
 
 		 460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.21 
 
 		 441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0844867 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  26.4 
 
 		 458 aa  133  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  29.08 
 
 		 467 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  28.27 
 
 		 476 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06020  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.11 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.14779  hitchhiker  0.000000000313227 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  27.65 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  28.54 
 
 		 480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  28.47 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  28.08 
 
 		 488 aa  131  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  32.71 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  28.25 
 
 		 458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  28.25 
 
 		 458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  30.4 
 
 		 397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  26.21 
 
 		 468 aa  130  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  28.44 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0652  RNA methyltransferase, TrmA family  31.11 
 
 		 441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000483498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  30.18 
 
 		 471 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  26.93 
 
 		 478 aa  127  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  25.56 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  25.8 
 
 		 435 aa  126  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.41 
 
 		 485 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  26.71 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1628  RNA methyltransferase, TrmA family  24.64 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  31.7 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  29.18 
 
 		 495 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0615  RNA methyltransferase  30.39 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13964  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  30.91 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  27.52 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  24.22 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  27.13 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  27.9 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  27.46 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  26.95 
 
 		 457 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  27.23 
 
 		 439 aa  120  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  27.63 
 
 		 461 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  27.63 
 
 		 461 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  28.63 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  25.81 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  38.79 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16200  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  31.17 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.808986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  26.4 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  30 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>