94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5984 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  100 
 
 
266 aa  544  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  80.6 
 
 
269 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  56.37 
 
 
288 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  46.86 
 
 
278 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  46.54 
 
 
270 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  48.11 
 
 
290 aa  215  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  48.06 
 
 
256 aa  214  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  46.39 
 
 
268 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  46.39 
 
 
268 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  45.63 
 
 
268 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  43.63 
 
 
270 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  42.67 
 
 
279 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  45.34 
 
 
272 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.77 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  40 
 
 
277 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.91 
 
 
271 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  39.91 
 
 
271 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  37.45 
 
 
276 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  34.24 
 
 
264 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  33.2 
 
 
287 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0481  hypothetical protein  33.89 
 
 
270 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  33.74 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2732  hypothetical protein  29.9 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.582474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  31.13 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  27.23 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  26.56 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  28.63 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  28.97 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  34.55 
 
 
154 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  34.97 
 
 
157 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  34.55 
 
 
154 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  27.34 
 
 
157 aa  62.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  29.68 
 
 
255 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  29.68 
 
 
253 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  35 
 
 
154 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  29.68 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  25.63 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  29.72 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  29.72 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  32.26 
 
 
150 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4155  hypothetical protein  25.94 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  27.95 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  25.76 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  31.61 
 
 
155 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  34.44 
 
 
156 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  35 
 
 
151 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  30.93 
 
 
163 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  26.32 
 
 
281 aa  55.8  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  34.48 
 
 
140 aa  55.8  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  32.43 
 
 
155 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  31.76 
 
 
156 aa  53.1  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  37.11 
 
 
138 aa  52.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  34.02 
 
 
156 aa  52.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  31.94 
 
 
153 aa  52  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  35.05 
 
 
162 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  31.96 
 
 
152 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  31.82 
 
 
164 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  34.27 
 
 
148 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  32.92 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  29.87 
 
 
156 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  34 
 
 
155 aa  50.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  29.87 
 
 
156 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  36 
 
 
161 aa  49.3  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  25.44 
 
 
280 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  31.96 
 
 
151 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  33.33 
 
 
153 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  27.74 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.22 
 
 
103 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  31.68 
 
 
161 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  34.95 
 
 
168 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  31.96 
 
 
151 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  32 
 
 
150 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  27.17 
 
 
155 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  27.84 
 
 
157 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  29.9 
 
 
155 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  36.29 
 
 
138 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  30.39 
 
 
150 aa  46.6  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  27.81 
 
 
163 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  32.99 
 
 
162 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  27.68 
 
 
162 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  32.63 
 
 
165 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  35.44 
 
 
102 aa  45.8  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  35.44 
 
 
110 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  32.32 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  35.44 
 
 
110 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.44 
 
 
107 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  28.89 
 
 
100 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  30.3 
 
 
150 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  29.63 
 
 
103 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.07 
 
 
98 aa  42.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  24.73 
 
 
103 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  30.38 
 
 
98 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.89 
 
 
103 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.89 
 
 
103 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>