83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3132 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  309  9e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  61.18 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  61.18 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  61.18 
 
 		 162 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  60 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  59.35 
 
 		 150 aa  180  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  58.06 
 
 		 151 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  57.05 
 
 		 163 aa  174  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  56.77 
 
 		 151 aa  173  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  55.77 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  55.77 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  54.84 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  50.64 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  57.85 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  51.28 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  43.87 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  42.31 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  42.31 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  44.44 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  37.82 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  42.04 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  45.75 
 
 		 258 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  43.51 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  42.04 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  42.95 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  45.83 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1258  sulfur covalently-binding protein  44.16 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  47.24 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  36.71 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  38.28 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  31.41 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  34.18 
 
 		 156 aa  84  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  35.9 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  36.88 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  43.02 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  32.28 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  33.76 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  34.62 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  31.01 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0009  thiosulfate-binding protein SoxY  29.14 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.616931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  35.34 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  41.49 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  31.33 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479994  hitchhiker  0.00586011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  33.58 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  37.25 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  26.92 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  36.17 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  32.92 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  25.81 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  32.5 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  33.63 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  32.09 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  31.85 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0201  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  24.2 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  30.5 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  30.3 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  29.49 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  30.93 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  33.98 
 
 		 283 aa  53.9  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0029  thiosulfate-binding protein SoxY  23.88 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  29.51 
 
 		 268 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  33.93 
 
 		 256 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  25.64 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  32.61 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  28.69 
 
 		 268 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  31.03 
 
 		 272 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  29.01 
 
 		 268 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  28.26 
 
 		 269 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  27.12 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  32.35 
 
 		 279 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  33.7 
 
 		 271 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  27.17 
 
 		 266 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  27.35 
 
 		 281 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  25.35 
 
 		 280 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  27.96 
 
 		 276 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  27.96 
 
 		 271 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  27.96 
 
 		 271 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  27.27 
 
 		 290 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  24.76 
 
 		 302 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  24.76 
 
 		 302 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  33.33 
 
 		 156 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>