87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3423 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 151 aa  303  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  94.7 
 
 		 151 aa  288  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  67.76 
 
 		 163 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  66.89 
 
 		 150 aa  203  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  67.11 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  67.11 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  64.9 
 
 		 150 aa  200  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  56.77 
 
 		 155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  56.77 
 
 		 155 aa  160  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  54.61 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  54.61 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  53.95 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  46.15 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  56.2 
 
 		 155 aa  130  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  55.37 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  46.15 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  46.05 
 
 		 162 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  45.81 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  45.81 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  43.14 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  43.31 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  44.97 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  50 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  45.83 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  37.18 
 
 		 157 aa  105  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  39.6 
 
 		 258 aa  103  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  47.06 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  40.52 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1258  sulfur covalently-binding protein  45.45 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  41.86 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  36.08 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  43.06 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  45.83 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0009  thiosulfate-binding protein SoxY  32.65 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.616931  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  38.31 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0201  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  38.85 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  39.39 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  34.93 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479994  hitchhiker  0.00586011 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  29.8 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0029  thiosulfate-binding protein SoxY  31.06 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  31.25 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  32.24 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  43.62 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  32.69 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  37.72 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  41.49 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  35.96 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  34.48 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  38.14 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  35.2 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  29.8 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  27.63 
 
 		 268 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  34.41 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  26.97 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  32.76 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  26.32 
 
 		 268 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  32.04 
 
 		 281 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  31.85 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  27.13 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  36.78 
 
 		 271 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  30.48 
 
 		 302 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  32.35 
 
 		 270 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  30.48 
 
 		 302 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  30.43 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  29.79 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.96 
 
 		 266 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  32.04 
 
 		 256 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  35.14 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  26.92 
 
 		 288 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.3 
 
 		 276 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  33.66 
 
 		 283 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  28.87 
 
 		 269 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  34.78 
 
 		 278 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  32.63 
 
 		 271 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.63 
 
 		 271 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  28.3 
 
 		 253 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  28.3 
 
 		 253 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  26.42 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  31.18 
 
 		 277 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  29.36 
 
 		 271 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  28.3 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  32.98 
 
 		 276 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  32.35 
 
 		 287 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  28.57 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  28.03 
 
 		 279 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>