79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3129 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  306  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  306  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  86.36 
 
 		 163 aa  265  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  67.76 
 
 		 151 aa  204  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  67.11 
 
 		 151 aa  202  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  62.5 
 
 		 150 aa  184  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  60.53 
 
 		 150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  55.13 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  52.26 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  52.26 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  51.61 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  50.64 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  48.37 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  49.37 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  46.84 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  47.1 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  51.24 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  44.03 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  44.59 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  44.59 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  47.02 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  48.39 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1258  sulfur covalently-binding protein  56.84 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  44.17 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  39.35 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  42.95 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  36.54 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  41.06 
 
 		 258 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  33.12 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  45.79 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  41.13 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  39.84 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  40 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  36.54 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  39.1 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  39.85 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  35.54 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479994  hitchhiker  0.00586011 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0009  thiosulfate-binding protein SoxY  29.53 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.616931  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  41.59 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  42.86 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  44.68 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  41.49 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  30.67 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  39.36 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  36.73 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0201  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  30.34 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  33.75 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  33.58 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  35.48 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  33.9 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  27.44 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0029  thiosulfate-binding protein SoxY  25.62 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  28.76 
 
 		 268 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  33.86 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  29.41 
 
 		 268 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  32.14 
 
 		 270 aa  52.4  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  33.33 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  33.02 
 
 		 288 aa  51.2  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  29.79 
 
 		 266 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  31.25 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  30.07 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.78 
 
 		 266 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  29.17 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  24.59 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  31.48 
 
 		 302 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  31.48 
 
 		 302 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  31.19 
 
 		 281 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  32.61 
 
 		 271 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  31.91 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  33.7 
 
 		 256 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  27.1 
 
 		 269 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  32.41 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  28.76 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  26.85 
 
 		 276 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  33 
 
 		 277 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  31.25 
 
 		 256 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  33.02 
 
 		 283 aa  41.6  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>