78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1668 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  335  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  55.19 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  56.29 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  43.2 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  44.37 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  49.61 
 
 		 258 aa  120  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  45.95 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  45.7 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  46.51 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  44 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  44 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  44.37 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  45.39 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  45.39 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  44.74 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  38.82 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  43.8 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  41.41 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  39.84 
 
 		 155 aa  88.2  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  37.2 
 
 		 156 aa  87.8  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  36.84 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  36.84 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  41.18 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  39.1 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  34.67 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  37.25 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  40.17 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  35 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  31.58 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  31.65 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  36.42 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1258  sulfur covalently-binding protein  42.27 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  37.76 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  40.35 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  34.29 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  43.88 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  33.96 
 
 		 157 aa  72  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  37.21 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  34.42 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  39.25 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0009  thiosulfate-binding protein SoxY  31.08 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.616931  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  35.71 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479994  hitchhiker  0.00586011 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  39.78 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  34.31 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  37.14 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  30.83 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  34.01 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  31.29 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  33.33 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  27.87 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  28.57 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  35.06 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  35.79 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  36.14 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  34.62 
 
 		 264 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0029  thiosulfate-binding protein SoxY  30.6 
 
 		 133 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  33.33 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  36.36 
 
 		 153 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  33.7 
 
 		 256 aa  51.2  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  32.43 
 
 		 302 aa  50.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  32.43 
 
 		 302 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  35.9 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  31 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  35.04 
 
 		 266 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  28.99 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  31.68 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  33.7 
 
 		 266 aa  48.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  36.96 
 
 		 271 aa  48.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  28.66 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  30.11 
 
 		 249 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  31.67 
 
 		 277 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  29.29 
 
 		 280 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  31.37 
 
 		 283 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  31.31 
 
 		 272 aa  44.7  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  30.08 
 
 		 278 aa  44.3  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  27.96 
 
 		 279 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  32.99 
 
 		 288 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  35.82 
 
 		 287 aa  41.2  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>