74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1576 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  100 
 
 		 156 aa  309  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  49.57 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  48.7 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  50.45 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  38.82 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  39.04 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  46.43 
 
 		 280 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  39.87 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  40.94 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  43.9 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  40.14 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  40.14 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  35.37 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  36.81 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  34.46 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  41.35 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  40.87 
 
 		 155 aa  87.4  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  33.06 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  47.42 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  33.56 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  42 
 
 		 270 aa  80.5  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  34.06 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  30.2 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  39.39 
 
 		 283 aa  68.2  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  34.36 
 
 		 287 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  35.48 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  32.91 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  35.22 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  33.97 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  36.36 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  34.21 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  29.87 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  36.29 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  30.72 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  33.06 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  33.06 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  32.8 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  36.64 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  26.58 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  38.18 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  38.18 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  31.91 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  37.27 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  29.22 
 
 		 280 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  31.91 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.32 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  35.14 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  34.26 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  29.29 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  33.93 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  32.32 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  35.87 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  35.05 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  29.41 
 
 		 279 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  35.14 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  35.34 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  28.76 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  30.3 
 
 		 288 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  31.33 
 
 		 258 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  33.04 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  28.87 
 
 		 276 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  34.91 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  28.45 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  35.05 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  30.83 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  28.93 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  30.93 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  26.02 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  24.74 
 
 		 271 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  24.74 
 
 		 271 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  28 
 
 		 290 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  26.42 
 
 		 266 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>