72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0261 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  100 
 
 
155 aa  315  1e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  47.5 
 
 
155 aa  140  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  43.79 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  52.21 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  43.14 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  40.52 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  42.57 
 
 
156 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  44.9 
 
 
162 aa  98.2  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  42.19 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  34.27 
 
 
280 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  45.54 
 
 
156 aa  94.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  39.13 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  40.82 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  40.37 
 
 
161 aa  90.5  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  43.9 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  37.74 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  39.62 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  32.32 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  39.1 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  38.85 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  39.1 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  38.85 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  37.66 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  43.88 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  39.51 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  33.96 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  32.8 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  36.48 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  35.85 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  35.85 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  38.52 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  36.48 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  36.25 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  38.99 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  38.99 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  38.51 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  32.69 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  38.52 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  36.02 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  31.65 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  33.55 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  35.4 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  37.72 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  39.8 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  40.19 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  31.01 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  33.64 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  38.89 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  37.96 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  32.91 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  31.65 
 
 
258 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  26.45 
 
 
280 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  31.65 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  26.45 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  35.22 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  33.13 
 
 
155 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  32.77 
 
 
270 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  36 
 
 
283 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  32.41 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1258  sulfur covalently-binding protein  37.25 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  31.96 
 
 
288 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.23 
 
 
266 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  32 
 
 
287 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  27.78 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479994  hitchhiker  0.00586011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  29.9 
 
 
269 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  27.33 
 
 
278 aa  43.9  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  24.83 
 
 
266 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  24.36 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  27.19 
 
 
155 aa  41.2  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  25.83 
 
 
279 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>