128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1269 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  45.39 
 
 
156 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  38.18 
 
 
154 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  38.18 
 
 
154 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  39.33 
 
 
162 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  43.92 
 
 
153 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  43.92 
 
 
153 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  42.72 
 
 
109 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  42.86 
 
 
109 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  33.12 
 
 
155 aa  97.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  35.33 
 
 
150 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  41.75 
 
 
109 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  36.36 
 
 
154 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  30.45 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  37.33 
 
 
156 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  37.74 
 
 
161 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  34.21 
 
 
157 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  42.39 
 
 
109 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  36.27 
 
 
109 aa  89  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  36.63 
 
 
109 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.31 
 
 
108 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3916  hypothetical protein  35.64 
 
 
109 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.37 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  28.64 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  37.01 
 
 
140 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  28.31 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  41.67 
 
 
158 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1575  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.5 
 
 
111 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  26.39 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  39 
 
 
138 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  50 
 
 
106 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  24.79 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  32.1 
 
 
155 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  26.62 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  25.5 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  25.5 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  27.95 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  41.24 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  34.34 
 
 
106 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  25.81 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  31.18 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  31.18 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.26 
 
 
106 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  25.66 
 
 
157 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  24.11 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2762  sulfur compound chelating protein SoxZ  31.07 
 
 
106 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  34.88 
 
 
155 aa  67  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.78 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  37.78 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  35.23 
 
 
103 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  26 
 
 
163 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  36.36 
 
 
103 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  29.63 
 
 
156 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  33.68 
 
 
111 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  28.04 
 
 
287 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  26.48 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  30.92 
 
 
150 aa  63.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0262  sulfur compound chelating protein SoxZ  31.63 
 
 
111 aa  61.6  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000855271  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  31.52 
 
 
104 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  38.55 
 
 
101 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.57 
 
 
103 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.57 
 
 
103 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  32.5 
 
 
151 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 
150 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.57 
 
 
103 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  25.7 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  39.76 
 
 
100 aa  59.3  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  34.19 
 
 
148 aa  58.9  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  33.33 
 
 
103 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  28.66 
 
 
156 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.63 
 
 
109 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  29.17 
 
 
103 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  28.66 
 
 
162 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  30.77 
 
 
103 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1155  putative sulfur oxidation protein  30.3 
 
 
109 aa  55.8  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.77518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.71 
 
 
107 aa  55.8  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  32.97 
 
 
108 aa  55.8  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.72 
 
 
101 aa  55.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  32.29 
 
 
103 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  23.6 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  25.81 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.33 
 
 
98 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0201  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  45.83 
 
 
150 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  32.95 
 
 
103 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  29.67 
 
 
108 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.18 
 
 
103 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  24.53 
 
 
162 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  31.96 
 
 
152 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  23.6 
 
 
268 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  34.02 
 
 
153 aa  52.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  32.67 
 
 
155 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  28.06 
 
 
271 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  22.89 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  30.86 
 
 
103 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  28.83 
 
 
164 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  30.43 
 
 
98 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  29.87 
 
 
103 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  23.57 
 
 
157 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  26.51 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  23.6 
 
 
102 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>