112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0297 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  52.48 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  45.64 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  45.12 
 
 		 277 aa  205  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  45.61 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  42.42 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  40.64 
 
 		 283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  41.15 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  41.77 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  41.77 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  42.19 
 
 		 276 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  37.93 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  41.22 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  39.74 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  37.84 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  38.61 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  38.31 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  36.72 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  40.19 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  36.64 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  34.78 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0481  hypothetical protein  31.94 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  30.45 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  38.52 
 
 		 156 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  36.94 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  38.74 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  38.74 
 
 		 154 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  36.36 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  28.51 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  34.72 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2732  hypothetical protein  28.1 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582474 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  38.89 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  38.89 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  35.14 
 
 		 157 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  42 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  41.25 
 
 		 100 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  28.45 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  34 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  28.8 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  29.03 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  34.31 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  23.66 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  31.3 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4155  hypothetical protein  26.36 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  25.5 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  28.24 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  32.35 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  34.02 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  29.13 
 
 		 111 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.4 
 
 		 98 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  32.77 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  33.72 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  34.02 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  35 
 
 		 151 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  41.67 
 
 		 103 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  31.82 
 
 		 104 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  30.93 
 
 		 155 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  32.19 
 
 		 157 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  27.91 
 
 		 98 aa  52.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  33.33 
 
 		 150 aa  52.4  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  34.78 
 
 		 108 aa  52  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  32.14 
 
 		 156 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  32.14 
 
 		 156 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  26.03 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  36.08 
 
 		 162 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  29.91 
 
 		 140 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  30.93 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.76 
 
 		 102 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  36.08 
 
 		 162 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  37.11 
 
 		 138 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  36.46 
 
 		 103 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.76 
 
 		 102 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  39.76 
 
 		 102 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  26.48 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  30.07 
 
 		 148 aa  49.7  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  26.48 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  31 
 
 		 168 aa  49.3  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  28.97 
 
 		 153 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  32.35 
 
 		 151 aa  48.9  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  27.7 
 
 		 156 aa  48.9  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  30.43 
 
 		 108 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  32.04 
 
 		 138 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  35.05 
 
 		 162 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  32.35 
 
 		 151 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  28.28 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  30.28 
 
 		 155 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  28.28 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  25.84 
 
 		 158 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  32.73 
 
 		 103 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.88 
 
 		 103 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  34.02 
 
 		 153 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.05 
 
 		 103 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.88 
 
 		 103 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  30.39 
 
 		 150 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  29.46 
 
 		 163 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  30.93 
 
 		 155 aa  45.8  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  31.03 
 
 		 103 aa  45.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  31.82 
 
 		 101 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>