65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7669 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  100 
 
 
153 aa  303  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  88.24 
 
 
153 aa  270  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  52.03 
 
 
162 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  54.41 
 
 
158 aa  140  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  53.98 
 
 
161 aa  134  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  43.86 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  43.86 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  41.38 
 
 
150 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  45.05 
 
 
154 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  40.41 
 
 
157 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  44.37 
 
 
280 aa  98.2  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  38.93 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  36.71 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  37.74 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  40.14 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  42.11 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  32.43 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  44.33 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  29.41 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  33.76 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  35.62 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  34.31 
 
 
270 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  29.75 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  26 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  30.56 
 
 
264 aa  60.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  29.22 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  32.85 
 
 
278 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  34.02 
 
 
283 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  32.69 
 
 
272 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  29.73 
 
 
287 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  32.11 
 
 
155 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  34.34 
 
 
269 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  29.38 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  36.36 
 
 
168 aa  51.2  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  25.32 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  32.39 
 
 
280 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  30.13 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  29.73 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  29.56 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  29.56 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  28.57 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  28.83 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  27.03 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.33 
 
 
266 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  29.7 
 
 
162 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  29.7 
 
 
162 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  31.58 
 
 
155 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  29.45 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  27.19 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  25.48 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  28.32 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  26.8 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  24.44 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  28.76 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  28.76 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  29.31 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  26.8 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  28.57 
 
 
258 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  32.11 
 
 
288 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  30.95 
 
 
276 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  29.91 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  27.95 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  28.66 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>