50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0065 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  100 
 
 		 158 aa  309  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  55.48 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  54.3 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  53.64 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  49.56 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  39.13 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  37.04 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  40.4 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  38.61 
 
 		 154 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  40.4 
 
 		 154 aa  94  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  39.33 
 
 		 156 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  32.9 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  40.82 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  40.13 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  30.46 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  38.94 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  34.69 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  31.78 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  44.33 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  32.72 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  28.78 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  30.1 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  37.78 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  26.85 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  28.85 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  33.04 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  25.95 
 
 		 264 aa  50.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  35.71 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  32.65 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  29.09 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  29.29 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  27.12 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  25.84 
 
 		 270 aa  47.4  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  26.73 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  28.1 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  35.35 
 
 		 168 aa  44.3  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  30.93 
 
 		 258 aa  43.9  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  26.53 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  28.38 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  30.61 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  28.38 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  26.8 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  26.97 
 
 		 272 aa  41.6  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  27.08 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  27.08 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  31.11 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  26.03 
 
 		 280 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>