36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1156 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  333  7.999999999999999e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  50 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  55.26 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  54.39 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  40.26 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  49.18 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  40.52 
 
 		 150 aa  114  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  40.8 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  40 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  42.34 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  40.82 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  40.31 
 
 		 280 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  38.85 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  39.82 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  35.37 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  40.18 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  43.3 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  35.43 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  31.9 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  29.55 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  33.7 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  24.49 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  35.48 
 
 		 264 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  28.93 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  26.75 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  32.61 
 
 		 283 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  30.58 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  30.48 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.68 
 
 		 266 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  29.66 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  28.79 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  38.89 
 
 		 272 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  28.7 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  28.43 
 
 		 269 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  26.61 
 
 		 278 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>