77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2806 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  100 
 
 		 138 aa  265  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  63.38 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  61.59 
 
 		 138 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  47.26 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  44.3 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  46.67 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  44.52 
 
 		 157 aa  104  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  46.22 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  45.13 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  36.91 
 
 		 162 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  45.95 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  40 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  39.04 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  42.66 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  38.94 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  39 
 
 		 280 aa  77  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  36.62 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  34.97 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  47.47 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  41.28 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  43.14 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  33.12 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  34.44 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  41.59 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  38.98 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  42.71 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  41.59 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  39.29 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  39.8 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  39.29 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  44.09 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  35 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  42.71 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  39.5 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  39.5 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  45.74 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  36 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  43.75 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  41.49 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  37.89 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  44.21 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  37.25 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  37.61 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  41.49 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  38.83 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  39.36 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  33.55 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  40.59 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  39.36 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  31.79 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  34.74 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  30.15 
 
 		 264 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  33.67 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  35.59 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1258  sulfur covalently-binding protein  37.63 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  34.69 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  39.13 
 
 		 256 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  34.75 
 
 		 272 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  32.04 
 
 		 270 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  31.18 
 
 		 279 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  38.3 
 
 		 266 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.29 
 
 		 266 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.31 
 
 		 271 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  33.68 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.31 
 
 		 276 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  31.31 
 
 		 271 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  31.93 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  31.73 
 
 		 283 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  33.33 
 
 		 270 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  34.41 
 
 		 256 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  27.84 
 
 		 287 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  28.71 
 
 		 278 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  33.02 
 
 		 281 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  34.65 
 
 		 269 aa  40  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>