77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2085 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  52.48 
 
 		 270 aa  256  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  49.41 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  42.16 
 
 		 283 aa  208  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  44.49 
 
 		 287 aa  206  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  41.25 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  41.25 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  41.25 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  44.68 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  44.44 
 
 		 266 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  38.55 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  39.31 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  34.63 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  41.59 
 
 		 279 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  38.89 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  38.59 
 
 		 270 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  41.03 
 
 		 256 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  37 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  36.48 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  36.48 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  36.25 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0481  hypothetical protein  30.91 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  32.67 
 
 		 156 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  26.39 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  35.24 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  35.77 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  32.26 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  32.65 
 
 		 157 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  34.78 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  34.15 
 
 		 154 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  29.51 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  32.32 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  30.67 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  31.03 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  35.05 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  28.2 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  28.88 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  25.54 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  25.89 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  26.1 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  32.88 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  26.97 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  31.65 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  32.37 
 
 		 153 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4155  hypothetical protein  25.9 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  32.64 
 
 		 148 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  33.33 
 
 		 155 aa  53.1  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  32.94 
 
 		 162 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  28 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  28 
 
 		 302 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  26.69 
 
 		 249 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  32.76 
 
 		 152 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  32.46 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  35.04 
 
 		 138 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  30.93 
 
 		 155 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  40 
 
 		 138 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  30.46 
 
 		 153 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  30.32 
 
 		 150 aa  48.5  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  31.86 
 
 		 162 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  30.69 
 
 		 140 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.49 
 
 		 98 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  26.73 
 
 		 110 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  26.73 
 
 		 110 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  34.31 
 
 		 151 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  29.13 
 
 		 111 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  30.89 
 
 		 155 aa  45.8  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  31.76 
 
 		 103 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  30.11 
 
 		 103 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1156  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  24.36 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2732  hypothetical protein  24.88 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582474 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  31.31 
 
 		 168 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  29.25 
 
 		 164 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.88 
 
 		 103 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  24.79 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  24.36 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  29.33 
 
 		 103 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>