60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1825 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  59.14 
 
 		 266 aa  310  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  47.33 
 
 		 271 aa  251  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  50.21 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  49.79 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  47.52 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  47.52 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2732  hypothetical protein  43.09 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582474 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4155  hypothetical protein  38.71 
 
 		 260 aa  178  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  40.25 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  37.27 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  37.27 
 
 		 253 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  37.27 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  26.07 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  27.08 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  28.8 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  24.27 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  26.67 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  24.37 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  26.53 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  23.53 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  25.19 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  23.53 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  32.86 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  27.59 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  25.19 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  26.1 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  34.41 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  27.19 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  29.82 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  26.23 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  26.32 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 		 151 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  24.33 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  32.04 
 
 		 151 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  33.33 
 
 		 153 aa  52.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  26.43 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  27.19 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  27.31 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  23.59 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  29.87 
 
 		 156 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  24.81 
 
 		 288 aa  48.9  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  29.87 
 
 		 156 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  27.63 
 
 		 156 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  28.24 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  27.03 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  25.93 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  30.07 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  28.87 
 
 		 162 aa  47  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  30.43 
 
 		 155 aa  46.6  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  31.52 
 
 		 150 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  27.83 
 
 		 154 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  37.35 
 
 		 100 aa  45.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  24.84 
 
 		 157 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  25.89 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  30.43 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.27 
 
 		 109 aa  43.5  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  26.53 
 
 		 154 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  30.63 
 
 		 163 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  30.23 
 
 		 109 aa  42.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>