69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2628 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  100 
 
 
103 aa  211  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  70.87 
 
 
103 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  67.96 
 
 
103 aa  153  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  64.08 
 
 
103 aa  144  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  61.17 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  59.22 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  60.19 
 
 
103 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  59.8 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  59.8 
 
 
103 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  59.22 
 
 
103 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  59.22 
 
 
103 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  63 
 
 
102 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  59.8 
 
 
103 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  59.8 
 
 
258 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  61.62 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  57.84 
 
 
103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  55.77 
 
 
104 aa  120  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  48.54 
 
 
103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  50 
 
 
102 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  50 
 
 
102 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  49.51 
 
 
107 aa  110  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  43.43 
 
 
100 aa  97.1  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  44.12 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  46.24 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  45.1 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  39.39 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  46.67 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  47.78 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.36 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  45.56 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  42.86 
 
 
98 aa  83.6  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  44.12 
 
 
102 aa  83.6  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  44.44 
 
 
109 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  44.71 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  47.31 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  43.9 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  43.9 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  44.83 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  39.53 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0010  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.81 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2073  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.18 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  38.38 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2057  sulfur oxidation protein SoxZ  33.67 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000174339  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  39.53 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  32.65 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.91 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3916  hypothetical protein  35.16 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1682  sulfur compound chelating protein SoxZ  33.67 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0124  Sulphur oxidation protein SoxZ  38.38 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  35.16 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1942  sulfur oxidation protein  34.74 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.73 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  31.71 
 
 
108 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  29.17 
 
 
280 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0202  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.61 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  28.05 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2762  sulfur compound chelating protein SoxZ  30.49 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  26.04 
 
 
106 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  24.44 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.57 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  29.58 
 
 
270 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1155  putative sulfur oxidation protein  30.16 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.77518  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  26.74 
 
 
264 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1575  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.21 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  29.33 
 
 
272 aa  42.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  30 
 
 
269 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0262  sulfur compound chelating protein SoxZ  31.33 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000855271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  25.56 
 
 
288 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  29.67 
 
 
256 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>