37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4155 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4155  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  44.25 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  40.17 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  42.17 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  45.37 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2732  hypothetical protein  41.3 
 
 		 255 aa  182  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  40.24 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  40.53 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  40.53 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  36.15 
 
 		 266 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  41.49 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  41.08 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  41.42 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  26.36 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.1 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  30.43 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  28.49 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  28.68 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  27.56 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  27.17 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  25.86 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  26.67 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  26.98 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  26.77 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  25.64 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  24.31 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  25.15 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  25.15 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  25.15 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  33.33 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  23.49 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  26.67 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  25.51 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  26.32 
 
 		 162 aa  45.8  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  25.3 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  25.16 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  24.65 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>