42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0724 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  50 
 
 		 281 aa  248  9e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  49.62 
 
 		 266 aa  244  8e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  50 
 
 		 302 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  50 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  47.86 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  44.44 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  43.82 
 
 		 253 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2732  hypothetical protein  42.29 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582474 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4155  hypothetical protein  42.17 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  45.02 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  42.63 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  42.23 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  28.51 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  26.05 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  25.65 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  28.94 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.3 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  25.98 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  25.98 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  27.04 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  29.52 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  26.81 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  23.5 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  23.5 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  25.87 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  23.5 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  28.02 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  23.73 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  28.64 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  33.33 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  26.56 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  31.61 
 
 		 151 aa  52.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  26.42 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  23.9 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  27.78 
 
 		 155 aa  46.2  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  33.64 
 
 		 155 aa  45.8  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  21.48 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  29.36 
 
 		 151 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  22.71 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  24.2 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  29.36 
 
 		 151 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>