46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3086 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  98.81 
 
 		 255 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  96.84 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  62.3 
 
 		 249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2732  hypothetical protein  43.29 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582474 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  42.61 
 
 		 271 aa  181  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  41.18 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  40.77 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  40.34 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  42.23 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  38.55 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4155  hypothetical protein  41.08 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  37.04 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  26.92 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  25.09 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.68 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  26.14 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  27.06 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  33.04 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  29.03 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  24.69 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  27.64 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  32.98 
 
 		 151 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  25.11 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  26.04 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  22.78 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.79 
 
 		 109 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  24.68 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  26.48 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  25.11 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  26.21 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  25.31 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  25.44 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2856  hypothetical protein  25.97 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967749  normal  0.0104603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  24.28 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  24.28 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0009  thiosulfate-binding protein SoxY  25 
 
 		 145 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.616931  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  29.91 
 
 		 162 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  25.21 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  28.3 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  24.9 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  25 
 
 		 155 aa  42.7  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  25 
 
 		 164 aa  42.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  25 
 
 		 155 aa  42  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  30.68 
 
 		 108 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  26.09 
 
 		 109 aa  42  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>