68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1933 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  100 
 
 		 268 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  86.94 
 
 		 268 aa  487  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  86.94 
 
 		 268 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  52.81 
 
 		 290 aa  256  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  51.94 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  48.12 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  47.13 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  48.31 
 
 		 269 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  46.38 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  44.07 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.59 
 
 		 271 aa  185  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  40.59 
 
 		 271 aa  185  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.59 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  41.7 
 
 		 279 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  36.72 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  37.39 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  36.32 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  36.25 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  33.61 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  30.8 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0481  hypothetical protein  34.42 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  31.03 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  28.87 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  30.41 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  30.24 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  35.78 
 
 		 150 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  34.69 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2732  hypothetical protein  26.75 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582474 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  33.03 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  34.02 
 
 		 163 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  31.01 
 
 		 157 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  25.83 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  25.1 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  26.56 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  29.86 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  24.69 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  38.46 
 
 		 107 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  28.1 
 
 		 163 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 151 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  24.37 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  29.41 
 
 		 156 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  29.41 
 
 		 156 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  25.49 
 
 		 151 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  26.52 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  26.52 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  27.71 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4155  hypothetical protein  25.2 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  29.01 
 
 		 155 aa  49.3  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  24.3 
 
 		 111 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  27.88 
 
 		 110 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  27.88 
 
 		 110 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.82 
 
 		 102 aa  46.6  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  31.91 
 
 		 161 aa  46.2  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.1 
 
 		 102 aa  46.6  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  35.11 
 
 		 138 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  27.17 
 
 		 103 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  35.42 
 
 		 140 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  24.31 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  29.41 
 
 		 100 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  28.97 
 
 		 162 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  30.3 
 
 		 148 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  30.11 
 
 		 108 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  35.71 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  29.55 
 
 		 102 aa  42.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  26.61 
 
 		 157 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  30.85 
 
 		 152 aa  42.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.05 
 
 		 98 aa  42  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  32.05 
 
 		 103 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>