66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2858 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  100 
 
 
108 aa  221  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  50.93 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  41.28 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  37.76 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  35.71 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  37.63 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  36.73 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  40 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  37.23 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  34.02 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  39.39 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.26 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.81 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  39.81 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  38.83 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  39.29 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  32.61 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0262  sulfur compound chelating protein SoxZ  33.66 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000855271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  35.71 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  35.71 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  37.25 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.29 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  37.21 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  35.85 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.37 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3916  hypothetical protein  33.67 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  35.16 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  36.9 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.79 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.79 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.31 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.63 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.49 
 
 
98 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2762  sulfur compound chelating protein SoxZ  29.9 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.61 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  35.11 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  35.29 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  35.16 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  35.56 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.41 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  31.4 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  34.94 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.94 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  35.14 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.33 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  31.65 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.56 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  38.57 
 
 
258 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  31.87 
 
 
104 aa  53.9  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  29.67 
 
 
280 aa  53.9  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1155  putative sulfur oxidation protein  29.59 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.77518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.83 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  33.96 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  34.78 
 
 
270 aa  52  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0010  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.43 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  26.74 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  29.79 
 
 
268 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  29.79 
 
 
268 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  31.65 
 
 
290 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  28.57 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  30.11 
 
 
268 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  32.1 
 
 
249 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1575  Sulphur oxidation protein SoxZ  24.21 
 
 
111 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  34.15 
 
 
271 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0202  sulfur compound chelating protein SoxZ  30.38 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  27.37 
 
 
278 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>