63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0010 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0010  Sulphur oxidation protein SoxZ  100 
 
 
102 aa  205  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  60.78 
 
 
102 aa  134  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  63.92 
 
 
98 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  61.86 
 
 
98 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  46.15 
 
 
102 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  43.62 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  42.55 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  43.48 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  44.57 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  43.48 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  43.96 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.82 
 
 
101 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.78 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.78 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  39.13 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.13 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  39.81 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  38.78 
 
 
101 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  40.22 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  40.78 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  37.86 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  39.81 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  37.25 
 
 
103 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  40.66 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  39.13 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.27 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  35.29 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  38.64 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  39.13 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  43.24 
 
 
258 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  35.96 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  35.96 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  34.04 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  36.96 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0124  Sulphur oxidation protein SoxZ  35.11 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  32.97 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1942  sulfur oxidation protein  34.07 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  38.98 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  35.37 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2073  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.21 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  32.43 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  32.18 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.95 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  28.72 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  34.48 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  25.53 
 
 
109 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3916  hypothetical protein  37.29 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  37.93 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.08 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  25.53 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  28.38 
 
 
280 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.27 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.21 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  28.24 
 
 
270 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.2 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2057  sulfur oxidation protein SoxZ  27.17 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000174339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  33.7 
 
 
269 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0262  sulfur compound chelating protein SoxZ  28.21 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000855271  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  30 
 
 
290 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  32.2 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0202  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.14 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  25.42 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.52 
 
 
266 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>