60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2805 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  100 
 
 		 109 aa  223  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3916  hypothetical protein  72.48 
 
 		 109 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  72.48 
 
 		 109 aa  165  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  58.25 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  57.41 
 
 		 109 aa  127  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  55.34 
 
 		 108 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  55.96 
 
 		 109 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  52.83 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  54.13 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  45.87 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  45.36 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2762  sulfur compound chelating protein SoxZ  43 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  36.27 
 
 		 280 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1575  Sulphur oxidation protein SoxZ  41.3 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  37.61 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  37.61 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  38.2 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  40.7 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  39.53 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  38.37 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  36.46 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.46 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.46 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  37.76 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1155  putative sulfur oxidation protein  35.78 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.77518  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.7 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  40.7 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  38.55 
 
 		 258 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  37.25 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  34.88 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  35.71 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  32.61 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.05 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.05 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  34.12 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  37.65 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  36.05 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.12 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  37.21 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  33.33 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.25 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  33.72 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  30.61 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.55 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  37.93 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.52 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  33.72 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.72 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  32.18 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  29.55 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  32.22 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  31.4 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2073  Sulphur oxidation protein SoxZ  40 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  30.85 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.03 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0010  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.48 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0262  sulfur compound chelating protein SoxZ  28.12 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000855271  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  27.47 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1942  sulfur oxidation protein  29.33 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1682  sulfur compound chelating protein SoxZ  27.91 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>