63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4158 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  100 
 
 
109 aa  222  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  61.11 
 
 
108 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  52.83 
 
 
109 aa  123  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3916  hypothetical protein  51.4 
 
 
109 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  50.47 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  49.04 
 
 
109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  50 
 
 
109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  50 
 
 
109 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  47.12 
 
 
109 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  44.79 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  39.13 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2762  sulfur compound chelating protein SoxZ  43.48 
 
 
106 aa  93.6  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  45.88 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  31.37 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1575  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.54 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1155  putative sulfur oxidation protein  43.01 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.77518  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  44.71 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  41.46 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  41.46 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  41.46 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  39.09 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  39.09 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  39.08 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  35.35 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  39.76 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  34.88 
 
 
101 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  37.36 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  42.17 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.69 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  34.69 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  40.96 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  39.02 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  37.65 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.48 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.8 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  38.55 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  38.55 
 
 
103 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.76 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  37.25 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.76 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  37.04 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.78 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  34.38 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2073  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.33 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  37.97 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  32.61 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  35.87 
 
 
103 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0262  sulfur compound chelating protein SoxZ  31.48 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000855271  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.48 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.21 
 
 
102 aa  57  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  34.41 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  31.46 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  32 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  28.26 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  37.7 
 
 
98 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  35.37 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0010  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.95 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1942  sulfur oxidation protein  28.21 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1682  sulfur compound chelating protein SoxZ  27.88 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  25.24 
 
 
270 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  27.71 
 
 
271 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  27.71 
 
 
271 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>