49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1155 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1155  putative sulfur oxidation protein  100 
 
 		 109 aa  226  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.77518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2762  sulfur compound chelating protein SoxZ  48 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  45.71 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  43.81 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  43.81 
 
 		 106 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  40.37 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  39.45 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.45 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  38.89 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  45.65 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  43.01 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3916  hypothetical protein  35.05 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  35.78 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  35.78 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1575  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.33 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  28.57 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  28.57 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  30.3 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  29.59 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  28.57 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  28.57 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  30.26 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  31.4 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  28.74 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.79 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.31 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  29.11 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  35.59 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  26.58 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.35 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  27.66 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  26.74 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  29.27 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  25.53 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  30.16 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  24.47 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.15 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  28.4 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  27.78 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  27.42 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  27.42 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.15 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  27.42 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  32.79 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  26.58 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  30.26 
 
 		 102 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  30.26 
 
 		 102 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  25 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  26.53 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>