62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4254 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  100 
 
 		 109 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  93.58 
 
 		 109 aa  215  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  87.16 
 
 		 109 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  74.31 
 
 		 109 aa  168  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  57.41 
 
 		 109 aa  127  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  55.88 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3916  hypothetical protein  54.13 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  57 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  47.12 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2762  sulfur compound chelating protein SoxZ  50 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  50 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  42.86 
 
 		 280 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  46 
 
 		 106 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  48.42 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  47.37 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  47.37 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  42 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1155  putative sulfur oxidation protein  38.89 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.77518  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  33.94 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  33.94 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  42.11 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  44.71 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1575  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.18 
 
 		 111 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  44.44 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  40.91 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  44.44 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  44.58 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  43.53 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  43.02 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.43 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  40.7 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.23 
 
 		 103 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.23 
 
 		 103 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  42.22 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  37.93 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  42.22 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  34.02 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  38.24 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  40.79 
 
 		 258 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  37.5 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  38.55 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.51 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  37 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.61 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.25 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  32.41 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  36.59 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  34.65 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  34.57 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2073  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.95 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.57 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  34.62 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  27.38 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.47 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.33 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1682  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.56 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0010  Sulphur oxidation protein SoxZ  25.53 
 
 		 102 aa  48.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1942  sulfur oxidation protein  30.68 
 
 		 97 aa  47.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0262  sulfur compound chelating protein SoxZ  27.27 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000855271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  22.73 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2057  sulfur oxidation protein SoxZ  32.56 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000174339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  25.58 
 
 		 270 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>