65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3254 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  100 
 
 
103 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  94.17 
 
 
103 aa  202  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  80.39 
 
 
103 aa  175  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  79.41 
 
 
103 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  79.41 
 
 
103 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  76.24 
 
 
102 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  73.27 
 
 
102 aa  163  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  65.05 
 
 
103 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  64.08 
 
 
103 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  64.08 
 
 
103 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  63.11 
 
 
103 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  63.11 
 
 
103 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  59.22 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  57.84 
 
 
103 aa  134  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  56.31 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  56.73 
 
 
104 aa  120  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  51.96 
 
 
258 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  50.49 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  45.45 
 
 
101 aa  107  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  46.46 
 
 
101 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  46.94 
 
 
102 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  46.94 
 
 
102 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  45.63 
 
 
103 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  49.02 
 
 
103 aa  103  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  48.04 
 
 
104 aa  100  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  49.02 
 
 
103 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  41.18 
 
 
102 aa  90.1  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  39.39 
 
 
100 aa  90.1  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0010  Sulphur oxidation protein SoxZ  44.57 
 
 
102 aa  84.3  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  38.78 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  46.08 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  48.35 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  48.35 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  40.7 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2073  Sulphur oxidation protein SoxZ  41.84 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  40.23 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  40.2 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.24 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  40.91 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  44.83 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  42.17 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  40.4 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2762  sulfur compound chelating protein SoxZ  35.56 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  35.56 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0124  Sulphur oxidation protein SoxZ  38.78 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2057  sulfur oxidation protein SoxZ  35.71 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000174339  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  34.31 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  37.21 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  34.07 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  33.02 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1682  sulfur compound chelating protein SoxZ  31.63 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  36.26 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  36.59 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3916  hypothetical protein  35.79 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0202  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.04 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1942  sulfur oxidation protein  29.29 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.69 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  29.87 
 
 
280 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  27.78 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1155  putative sulfur oxidation protein  32.79 
 
 
109 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.77518  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1575  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.86 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  30.86 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  32.22 
 
 
269 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  30 
 
 
266 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0262  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.14 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000855271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>