62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4959 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  100 
 
 		 109 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  89.91 
 
 		 109 aa  205  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  87.16 
 
 		 109 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  74.31 
 
 		 109 aa  170  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3916  hypothetical protein  55.05 
 
 		 109 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  58.25 
 
 		 109 aa  130  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  56.86 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  54.13 
 
 		 109 aa  126  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  49.04 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2762  sulfur compound chelating protein SoxZ  51.92 
 
 		 106 aa  113  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  42.72 
 
 		 280 aa  98.6  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  50.56 
 
 		 106 aa  95.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  46.07 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  41 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  46.15 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  45.05 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  45.05 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1155  putative sulfur oxidation protein  39.45 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.77518  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  45.56 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  45.56 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1575  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.25 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  45.68 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  42.22 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  35.11 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  41.51 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  35.11 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  43.21 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  40 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  42.68 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  42.68 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  45.57 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  40.24 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  35.71 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  40.24 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  41.46 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  40.79 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  38.46 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  38.89 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  38.89 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  40.24 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  36.27 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  33.7 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  31.19 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.5 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  37.8 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  36.26 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.22 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  40 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  30 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.25 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2073  Sulphur oxidation protein SoxZ  43.55 
 
 		 101 aa  57  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  34.57 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  34.62 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  30.26 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  29.33 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0262  sulfur compound chelating protein SoxZ  26.04 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000855271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0010  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.08 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  32.14 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1682  sulfur compound chelating protein SoxZ  29.63 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  25.58 
 
 		 270 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1942  sulfur oxidation protein  28.41 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2057  sulfur oxidation protein SoxZ  29.07 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000174339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>