71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3131 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  100 
 
 
103 aa  210  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  65.69 
 
 
103 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  59.8 
 
 
103 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  59.8 
 
 
103 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  65.69 
 
 
103 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  64.71 
 
 
103 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  58.82 
 
 
103 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  58.82 
 
 
103 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  57.84 
 
 
103 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  58.82 
 
 
103 aa  133  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  56.86 
 
 
107 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  56.86 
 
 
103 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  58.42 
 
 
102 aa  129  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  57.84 
 
 
103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  55.45 
 
 
102 aa  123  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  52.94 
 
 
103 aa  120  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  55.34 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  47.96 
 
 
101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  47.47 
 
 
100 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  46.94 
 
 
101 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  45.45 
 
 
102 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  45.45 
 
 
102 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  45.1 
 
 
103 aa  98.2  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  41.18 
 
 
258 aa  94  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  41.75 
 
 
103 aa  92  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  39.81 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  42.16 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  44.58 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  42.16 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  43.37 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.8 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  43.14 
 
 
103 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  45.57 
 
 
109 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  43.33 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0010  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.13 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  36.46 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2057  sulfur oxidation protein SoxZ  39.8 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000174339  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.68 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  34.34 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2073  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.76 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  37.65 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  36.84 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  36.84 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.97 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3916  hypothetical protein  35.79 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  35.58 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  38.27 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0124  Sulphur oxidation protein SoxZ  35.35 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  34.41 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1942  sulfur oxidation protein  33.67 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.29 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  38.46 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  35.8 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2762  sulfur compound chelating protein SoxZ  30.11 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.52 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  34.18 
 
 
280 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  26.88 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0202  sulfur compound chelating protein SoxZ  31.87 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1682  sulfur compound chelating protein SoxZ  25 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  33.7 
 
 
269 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  28.89 
 
 
288 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  29.35 
 
 
268 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.22 
 
 
266 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  28.26 
 
 
268 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  32.5 
 
 
290 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  27.17 
 
 
268 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1155  putative sulfur oxidation protein  24.47 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.77518  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1575  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.29 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.67 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  30.38 
 
 
270 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>