78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3674 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  100 
 
 		 103 aa  211  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  68.93 
 
 		 103 aa  156  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  70.59 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  55.34 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  53 
 
 		 102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  53 
 
 		 102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  47.37 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  48.39 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  46.32 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  47.31 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  45.63 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  46.08 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  44.09 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  41.75 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  44.09 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  41.75 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  41.75 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  43.14 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  44.12 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  41.94 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  40.2 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  39 
 
 		 100 aa  90.5  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  41.3 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.2 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  44.09 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  38.71 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  41.18 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  40.62 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  40.62 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  40 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2073  Sulphur oxidation protein SoxZ  40.82 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  43.18 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0010  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.13 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.89 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  36.27 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  34.62 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  34.62 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.17 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  37.5 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1942  sulfur oxidation protein  38 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1682  sulfur compound chelating protein SoxZ  33 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  35.23 
 
 		 280 aa  67.8  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2057  sulfur oxidation protein SoxZ  38.71 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000174339  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  35.63 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.41 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.52 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0124  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.65 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  35.58 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  34.48 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  30.48 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  28.89 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  35.63 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2762  sulfur compound chelating protein SoxZ  28.89 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  28.42 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3916  hypothetical protein  34.48 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  30.77 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  35.8 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  31 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0262  sulfur compound chelating protein SoxZ  28 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000855271  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  34.83 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  30.43 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1155  putative sulfur oxidation protein  32.1 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.77518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  29.63 
 
 		 272 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  31.17 
 
 		 283 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1575  Sulphur oxidation protein SoxZ  27.17 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  32.1 
 
 		 271 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.1 
 
 		 271 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  31.03 
 
 		 290 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  28.92 
 
 		 264 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.1 
 
 		 276 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0202  sulfur compound chelating protein SoxZ  25.74 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  34.07 
 
 		 256 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  26.97 
 
 		 266 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  29.07 
 
 		 268 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  30.14 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  29.07 
 
 		 268 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>