41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0124 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0124  Sulphur oxidation protein SoxZ  100 
 
 
94 aa  193  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  50 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  50 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1942  sulfur oxidation protein  46.81 
 
 
97 aa  89.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  41 
 
 
103 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3045  hypothetical protein  41.84 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  42.11 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  40 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  40 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  40 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  41.49 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1682  sulfur compound chelating protein SoxZ  36.56 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  39.8 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1669  hypothetical protein  39.8 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  41.84 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  38.78 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  35.92 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  38.38 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  33 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  38.78 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  38.38 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  37.23 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.01 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  35 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  35.35 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  35.79 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.01 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  31.68 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  37.11 
 
 
258 aa  58.9  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0010  Sulphur oxidation protein SoxZ  35.11 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  29.17 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.74 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.69 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  34.34 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.48 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  30.69 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.67 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2073  Sulphur oxidation protein SoxZ  24.24 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0202  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.02 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  32.91 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  32.91 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>