67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2818 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  60.62 
 
 
256 aa  274  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  48.54 
 
 
302 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  47.52 
 
 
281 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  48.12 
 
 
302 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  47.86 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4155  hypothetical protein  42.15 
 
 
260 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  46.12 
 
 
266 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2732  hypothetical protein  44.93 
 
 
255 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.582474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  45.61 
 
 
249 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  41.22 
 
 
255 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  40.61 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  40.23 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  30.29 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  27.54 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  28.15 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  24.15 
 
 
279 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  25.38 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  25.9 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  27.95 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  26.69 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  25.63 
 
 
271 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  25.63 
 
 
271 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  30.82 
 
 
156 aa  56.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  25.89 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  29.63 
 
 
268 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  35.11 
 
 
151 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  25.94 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  29.63 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  28.76 
 
 
162 aa  53.5  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  29.17 
 
 
268 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  27.47 
 
 
277 aa  53.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  27.4 
 
 
269 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  24.37 
 
 
276 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  30.58 
 
 
154 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  30.61 
 
 
154 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  28.8 
 
 
280 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  28.93 
 
 
154 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  29.73 
 
 
157 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  34.78 
 
 
151 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  32.26 
 
 
157 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  34.78 
 
 
152 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  36.78 
 
 
151 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  33.33 
 
 
100 aa  49.7  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  32.73 
 
 
140 aa  49.7  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  31.71 
 
 
138 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  36.96 
 
 
168 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  26.23 
 
 
155 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  31.58 
 
 
153 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  25.69 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  33.7 
 
 
155 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  23.19 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  23.11 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  32.61 
 
 
156 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  32.61 
 
 
156 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  29.32 
 
 
162 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  27.43 
 
 
155 aa  45.8  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  33.33 
 
 
138 aa  45.8  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  27.36 
 
 
164 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  30.39 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  30.85 
 
 
157 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3454  translation initiation factor IF-2  34.09 
 
 
108 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  32.61 
 
 
150 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  31.52 
 
 
150 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  30.85 
 
 
161 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1258  sulfur covalently-binding protein  32.61 
 
 
154 aa  43.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  26.69 
 
 
256 aa  42.7  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>