69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2590 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  543  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  98.88 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  86.94 
 
 		 268 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  52.81 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  52.9 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  49.44 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  50.42 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  47.95 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  47.66 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  39.75 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  42.55 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.75 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  41.64 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  39.75 
 
 		 276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  38.61 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  36.97 
 
 		 276 aa  155  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  38.66 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  36.48 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  33.07 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  34.3 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0481  hypothetical protein  32.78 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  30.51 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  28.63 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  27.92 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  33.08 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  33.94 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  34.69 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  25.98 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  33.03 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  28.33 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  28.76 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  27.63 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  25.1 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  29.12 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  38.46 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  29.41 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  29.41 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2732  hypothetical protein  27.81 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582474 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  29.38 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  23.6 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  25.85 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  23.79 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  29.51 
 
 		 155 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  23.79 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  24.68 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  24.68 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  36.17 
 
 		 138 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  23.85 
 
 		 111 aa  48.9  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  32.98 
 
 		 161 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4155  hypothetical protein  24.71 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  29.79 
 
 		 108 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  27.87 
 
 		 162 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.5 
 
 		 98 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  26.21 
 
 		 110 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  26.21 
 
 		 110 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  29.36 
 
 		 162 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  29.36 
 
 		 162 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0009  Sulphur oxidation protein SoxZ  30.38 
 
 		 102 aa  45.8  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324159  hitchhiker  0.00558497 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  28.26 
 
 		 103 aa  45.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  30.3 
 
 		 100 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  30.77 
 
 		 103 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  33.65 
 
 		 140 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0030  sulfur oxidation protein SoxZ  30 
 
 		 98 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.938219  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  31.79 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  25.58 
 
 		 155 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  27.59 
 
 		 109 aa  42.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  26.52 
 
 		 155 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  30.1 
 
 		 165 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>