68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0471 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  62.5 
 
 		 281 aa  301  9e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  52.89 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  52.89 
 
 		 302 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  49.62 
 
 		 271 aa  244  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  51.24 
 
 		 256 aa  234  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  46.12 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2732  hypothetical protein  39.83 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582474 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4155  hypothetical protein  36.15 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  38.96 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  38.55 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  37.75 
 
 		 253 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  39.38 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  30.04 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  28.74 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  26.27 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  28.63 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  26.74 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  28.63 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  28.87 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  24.79 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  24.79 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  25.53 
 
 		 276 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  28.32 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  27.66 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  28.45 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  25.2 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  26.2 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  27.41 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  28.31 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  24.69 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  27.66 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  32.85 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  29.93 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  27.84 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  27.71 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  31.33 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  31.37 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  30.08 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  31.03 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  33.91 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  34.78 
 
 		 155 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  33.93 
 
 		 152 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  37.72 
 
 		 163 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  29.55 
 
 		 164 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  31.4 
 
 		 150 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  32.61 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  29.79 
 
 		 156 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  29.79 
 
 		 156 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 150 aa  48.9  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  29.08 
 
 		 163 aa  48.9  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  32.5 
 
 		 157 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  27.41 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  33.7 
 
 		 168 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  32.26 
 
 		 164 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  38.3 
 
 		 138 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  30.43 
 
 		 154 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  26.02 
 
 		 157 aa  45.4  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  28.28 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  26.92 
 
 		 162 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  37.5 
 
 		 100 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  22.83 
 
 		 157 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  27.17 
 
 		 155 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  24.83 
 
 		 155 aa  43.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  32.61 
 
 		 138 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  31.31 
 
 		 154 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>