71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3185 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  100 
 
 		 276 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1736  Sulphur oxidation protein SoxZ  61.04 
 
 		 276 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2111  Sulphur oxidation protein SoxZ  60.73 
 
 		 271 aa  318  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0330798  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1775  sulphur oxidation protein SoxZ  60.73 
 
 		 271 aa  318  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1964  sulphur oxidation protein SoxZ  54.81 
 
 		 279 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  40.17 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  36.8 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2358  hypothetical protein  39.84 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2085  hypothetical protein  40.33 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.76 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  38.91 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0297  hypothetical protein  38.31 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.094043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5953  hypothetical protein  37.86 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3111  sulphur oxidation protein SoxZ  37.2 
 
 		 277 aa  161  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0470  sulphur oxidation protein SoxZ  36.6 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  36.97 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  36.97 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  37.39 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  29.89 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3116  hypothetical protein  30.8 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  29.66 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0481  hypothetical protein  28.03 
 
 		 270 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  25.2 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  26.48 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  33.04 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  30.7 
 
 		 154 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2732  hypothetical protein  23.68 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582474 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  26.11 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  37.23 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  26.28 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  30.7 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  33.67 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  33.83 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1960  hypothetical protein  25.68 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0696001  normal  0.328417 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  33.33 
 
 		 138 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  23.79 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  30 
 
 		 157 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  32.91 
 
 		 162 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  24.88 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  34.02 
 
 		 150 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  28.28 
 
 		 163 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  29.63 
 
 		 156 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 150 aa  49.3  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  25.11 
 
 		 253 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  32.98 
 
 		 155 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  25.44 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  30.3 
 
 		 156 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1825  hypothetical protein  21.51 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  25.11 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1025  hypothetical protein  25.34 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  27.55 
 
 		 162 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  46.6  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  30.85 
 
 		 155 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  25.74 
 
 		 157 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  28.19 
 
 		 150 aa  45.8  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  27.5 
 
 		 111 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0724  hypothetical protein  21.48 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 		 161 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  32.63 
 
 		 165 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1576  sulfur oxidation protein SoxY  29.85 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0029  thiosulfate-binding protein SoxY  32.5 
 
 		 133 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  26.85 
 
 		 163 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1468  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.24 
 
 		 109 aa  42.7  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00170779  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  23.75 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  23.75 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  30.95 
 
 		 153 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  26.85 
 
 		 156 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  26.85 
 
 		 156 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  28.87 
 
 		 162 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  28.87 
 
 		 162 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  30.41 
 
 		 164 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>